Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA42

Uncharacterized protein C20orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DA42 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q9DA42 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q9DA42 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q9DA42 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q9DA42 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q9DA42 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q9DA42 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q9DA42 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q9DA42 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q9DA42 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q9DA42 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Q9DA42 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q9DA42 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Q9DA42 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q9DA42 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q9DA42 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q9DA42 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q9DA42 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q9DA42 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q9DA42 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q9DA42 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q9DA42 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q9DA42 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q9DA42 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q9DA42 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q9DA42 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q9DA42 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Q9DA42 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Q9DA42 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Q9DA42 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q9DA42 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Q9DA42 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Q9DA42 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q9DA42 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q9DA42 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q9DA42 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q9DA42 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q9DA42 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q9DA42 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q9DA42 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q9DA42 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q9DA42 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q9DA42 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q9DA42 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Q9DA42 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Q9DA42 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Q9DA42 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Q9DA42 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Q9DA42 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Q9DA42 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q9DA42 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q9DA42 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Q9DA42 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q9DA42 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q9DA42 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q9DA42 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Q9DA42 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q9DA42 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q9DA42 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q9DA42 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q9DA42 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q9DA42 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q9DA42 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q9DA42 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Q9DA42 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q9DA42 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q9DA42 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q9DA42 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q9DA42 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q9DA42 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q9DA42 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q9DA42 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q9DA42 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q9DA42 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q9DA42 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q9DA42 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q9DA42 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q9DA42 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q9DA42 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q9DA42 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q9DA42 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q9DA42 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q9DA42 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q9DA42 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q9DA42 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q9DA42 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q9DA42 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q9DA42 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q9DA42 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Q9DA42 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q9DA42 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q9DA42 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q9DA42 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q9DA42 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Q9DA42 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q9DA42 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q9DA42 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q9DA42 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q9DA42 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q9DA42 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms