Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA08

Sgf29, SAGA-associated factor 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgf29Q9DA08 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sgf29Q9DA08 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sgf29Q9DA08 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Sgf29Q9DA08 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sgf29Q9DA08 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sgf29Q9DA08 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sgf29Q9DA08 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Sgf29Q9DA08 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sgf29Q9DA08 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sgf29Q9DA08 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sgf29Q9DA08 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sgf29Q9DA08 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Sgf29Q9DA08 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sgf29Q9DA08 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Sgf29Q9DA08 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sgf29Q9DA08 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sgf29Q9DA08 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sgf29Q9DA08 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Sgf29Q9DA08 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Sgf29Q9DA08 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sgf29Q9DA08 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sgf29Q9DA08 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sgf29Q9DA08 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sgf29Q9DA08 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sgf29Q9DA08 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sgf29Q9DA08 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sgf29Q9DA08 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sgf29Q9DA08 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sgf29Q9DA08 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sgf29Q9DA08 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sgf29Q9DA08 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sgf29Q9DA08 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sgf29Q9DA08 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sgf29Q9DA08 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sgf29Q9DA08 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sgf29Q9DA08 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Sgf29Q9DA08 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sgf29Q9DA08 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sgf29Q9DA08 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sgf29Q9DA08 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sgf29Q9DA08 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sgf29Q9DA08 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sgf29Q9DA08 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sgf29Q9DA08 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sgf29Q9DA08 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sgf29Q9DA08 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sgf29Q9DA08 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sgf29Q9DA08 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Sgf29Q9DA08 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sgf29Q9DA08 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sgf29Q9DA08 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sgf29Q9DA08 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sgf29Q9DA08 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sgf29Q9DA08 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sgf29Q9DA08 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sgf29Q9DA08 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sgf29Q9DA08 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sgf29Q9DA08 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sgf29Q9DA08 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sgf29Q9DA08 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sgf29Q9DA08 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Sgf29Q9DA08 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sgf29Q9DA08 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sgf29Q9DA08 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sgf29Q9DA08 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sgf29Q9DA08 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sgf29Q9DA08 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sgf29Q9DA08 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sgf29Q9DA08 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sgf29Q9DA08 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sgf29Q9DA08 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sgf29Q9DA08 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Sgf29Q9DA08 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sgf29Q9DA08 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sgf29Q9DA08 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sgf29Q9DA08 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sgf29Q9DA08 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sgf29Q9DA08 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Sgf29Q9DA08 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sgf29Q9DA08 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Sgf29Q9DA08 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sgf29Q9DA08 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sgf29Q9DA08 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sgf29Q9DA08 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sgf29Q9DA08 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sgf29Q9DA08 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sgf29Q9DA08 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sgf29Q9DA08 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sgf29Q9DA08 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sgf29Q9DA08 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sgf29Q9DA08 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sgf29Q9DA08 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sgf29Q9DA08 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Sgf29Q9DA08 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sgf29Q9DA08 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sgf29Q9DA08 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sgf29Q9DA08 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Sgf29Q9DA08 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sgf29Q9DA08 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Sgf29Q9DA08 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms