Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z7

Subh2bv, Histone H2B subacrosomal variant, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Subh2bvQ9D9Z7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Subh2bvQ9D9Z7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Subh2bvQ9D9Z7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Subh2bvQ9D9Z7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Subh2bvQ9D9Z7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Subh2bvQ9D9Z7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Subh2bvQ9D9Z7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Subh2bvQ9D9Z7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Subh2bvQ9D9Z7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Subh2bvQ9D9Z7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Subh2bvQ9D9Z7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Subh2bvQ9D9Z7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Subh2bvQ9D9Z7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Subh2bvQ9D9Z7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Subh2bvQ9D9Z7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Subh2bvQ9D9Z7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Subh2bvQ9D9Z7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Subh2bvQ9D9Z7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Subh2bvQ9D9Z7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Subh2bvQ9D9Z7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Subh2bvQ9D9Z7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Subh2bvQ9D9Z7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Subh2bvQ9D9Z7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Subh2bvQ9D9Z7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Subh2bvQ9D9Z7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Subh2bvQ9D9Z7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Subh2bvQ9D9Z7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Subh2bvQ9D9Z7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Subh2bvQ9D9Z7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Subh2bvQ9D9Z7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Subh2bvQ9D9Z7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Subh2bvQ9D9Z7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Subh2bvQ9D9Z7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Subh2bvQ9D9Z7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Subh2bvQ9D9Z7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Subh2bvQ9D9Z7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Subh2bvQ9D9Z7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Subh2bvQ9D9Z7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Subh2bvQ9D9Z7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Subh2bvQ9D9Z7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Subh2bvQ9D9Z7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Subh2bvQ9D9Z7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Subh2bvQ9D9Z7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Subh2bvQ9D9Z7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Subh2bvQ9D9Z7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Subh2bvQ9D9Z7 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Subh2bvQ9D9Z7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Subh2bvQ9D9Z7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Subh2bvQ9D9Z7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Subh2bvQ9D9Z7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Subh2bvQ9D9Z7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Subh2bvQ9D9Z7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Subh2bvQ9D9Z7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Subh2bvQ9D9Z7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Subh2bvQ9D9Z7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Subh2bvQ9D9Z7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Subh2bvQ9D9Z7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Subh2bvQ9D9Z7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Subh2bvQ9D9Z7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Subh2bvQ9D9Z7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Subh2bvQ9D9Z7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Subh2bvQ9D9Z7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Subh2bvQ9D9Z7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Subh2bvQ9D9Z7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Subh2bvQ9D9Z7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Subh2bvQ9D9Z7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Subh2bvQ9D9Z7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Subh2bvQ9D9Z7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Subh2bvQ9D9Z7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Subh2bvQ9D9Z7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Subh2bvQ9D9Z7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Subh2bvQ9D9Z7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Subh2bvQ9D9Z7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Subh2bvQ9D9Z7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Subh2bvQ9D9Z7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Subh2bvQ9D9Z7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Subh2bvQ9D9Z7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Subh2bvQ9D9Z7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Subh2bvQ9D9Z7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Subh2bvQ9D9Z7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Subh2bvQ9D9Z7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Subh2bvQ9D9Z7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Subh2bvQ9D9Z7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Subh2bvQ9D9Z7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Subh2bvQ9D9Z7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Subh2bvQ9D9Z7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Subh2bvQ9D9Z7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Subh2bvQ9D9Z7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Subh2bvQ9D9Z7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Subh2bvQ9D9Z7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Subh2bvQ9D9Z7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Subh2bvQ9D9Z7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Subh2bvQ9D9Z7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Subh2bvQ9D9Z7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Subh2bvQ9D9Z7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Subh2bvQ9D9Z7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Subh2bvQ9D9Z7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms