Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9J8

Bpifa3, BPI fold-containing family A member 3, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bpifa3Q9D9J8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bpifa3Q9D9J8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bpifa3Q9D9J8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bpifa3Q9D9J8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bpifa3Q9D9J8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bpifa3Q9D9J8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Bpifa3Q9D9J8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bpifa3Q9D9J8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bpifa3Q9D9J8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bpifa3Q9D9J8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bpifa3Q9D9J8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bpifa3Q9D9J8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bpifa3Q9D9J8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bpifa3Q9D9J8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bpifa3Q9D9J8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bpifa3Q9D9J8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bpifa3Q9D9J8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bpifa3Q9D9J8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bpifa3Q9D9J8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bpifa3Q9D9J8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bpifa3Q9D9J8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bpifa3Q9D9J8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bpifa3Q9D9J8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bpifa3Q9D9J8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bpifa3Q9D9J8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bpifa3Q9D9J8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bpifa3Q9D9J8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bpifa3Q9D9J8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bpifa3Q9D9J8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Bpifa3Q9D9J8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Bpifa3Q9D9J8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Bpifa3Q9D9J8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Bpifa3Q9D9J8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Bpifa3Q9D9J8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Bpifa3Q9D9J8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Bpifa3Q9D9J8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bpifa3Q9D9J8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Bpifa3Q9D9J8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Bpifa3Q9D9J8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Bpifa3Q9D9J8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bpifa3Q9D9J8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bpifa3Q9D9J8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bpifa3Q9D9J8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bpifa3Q9D9J8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bpifa3Q9D9J8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Bpifa3Q9D9J8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Bpifa3Q9D9J8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Bpifa3Q9D9J8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Bpifa3Q9D9J8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Bpifa3Q9D9J8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Bpifa3Q9D9J8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Bpifa3Q9D9J8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Bpifa3Q9D9J8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Bpifa3Q9D9J8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Bpifa3Q9D9J8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Bpifa3Q9D9J8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Bpifa3Q9D9J8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Bpifa3Q9D9J8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Bpifa3Q9D9J8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Bpifa3Q9D9J8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Bpifa3Q9D9J8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Bpifa3Q9D9J8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Bpifa3Q9D9J8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Bpifa3Q9D9J8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Bpifa3Q9D9J8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Bpifa3Q9D9J8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Bpifa3Q9D9J8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Bpifa3Q9D9J8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Bpifa3Q9D9J8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Bpifa3Q9D9J8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Bpifa3Q9D9J8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Bpifa3Q9D9J8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Bpifa3Q9D9J8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Bpifa3Q9D9J8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Bpifa3Q9D9J8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Bpifa3Q9D9J8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Bpifa3Q9D9J8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Bpifa3Q9D9J8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Bpifa3Q9D9J8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Bpifa3Q9D9J8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Bpifa3Q9D9J8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Bpifa3Q9D9J8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Bpifa3Q9D9J8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Bpifa3Q9D9J8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Bpifa3Q9D9J8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Bpifa3Q9D9J8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Bpifa3Q9D9J8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Bpifa3Q9D9J8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Bpifa3Q9D9J8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Bpifa3Q9D9J8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Bpifa3Q9D9J8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Bpifa3Q9D9J8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Bpifa3Q9D9J8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Bpifa3Q9D9J8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Bpifa3Q9D9J8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Bpifa3Q9D9J8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Bpifa3Q9D9J8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Bpifa3Q9D9J8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Bpifa3Q9D9J8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Bpifa3Q9D9J8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms