Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7W5

Med8, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med8Q9D7W5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Med8Q9D7W5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Med8Q9D7W5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Med8Q9D7W5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Med8Q9D7W5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Med8Q9D7W5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Med8Q9D7W5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Med8Q9D7W5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Med8Q9D7W5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Med8Q9D7W5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Med8Q9D7W5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Med8Q9D7W5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Med8Q9D7W5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Med8Q9D7W5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Med8Q9D7W5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Med8Q9D7W5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Med8Q9D7W5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Med8Q9D7W5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Med8Q9D7W5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Med8Q9D7W5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Med8Q9D7W5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Med8Q9D7W5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Med8Q9D7W5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Med8Q9D7W5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Med8Q9D7W5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Med8Q9D7W5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Med8Q9D7W5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Med8Q9D7W5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Med8Q9D7W5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Med8Q9D7W5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Med8Q9D7W5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Med8Q9D7W5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Med8Q9D7W5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Med8Q9D7W5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Med8Q9D7W5 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Med8Q9D7W5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Med8Q9D7W5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Med8Q9D7W5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Med8Q9D7W5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Med8Q9D7W5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Med8Q9D7W5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Med8Q9D7W5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Med8Q9D7W5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Med8Q9D7W5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Med8Q9D7W5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Med8Q9D7W5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Med8Q9D7W5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Med8Q9D7W5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Med8Q9D7W5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Med8Q9D7W5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Med8Q9D7W5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Med8Q9D7W5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Med8Q9D7W5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Med8Q9D7W5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Med8Q9D7W5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Med8Q9D7W5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Med8Q9D7W5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Med8Q9D7W5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Med8Q9D7W5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Med8Q9D7W5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Med8Q9D7W5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Med8Q9D7W5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Med8Q9D7W5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Med8Q9D7W5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Med8Q9D7W5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Med8Q9D7W5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Med8Q9D7W5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Med8Q9D7W5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Med8Q9D7W5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Med8Q9D7W5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Med8Q9D7W5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Med8Q9D7W5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Med8Q9D7W5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Med8Q9D7W5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Med8Q9D7W5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Med8Q9D7W5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Med8Q9D7W5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Med8Q9D7W5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Med8Q9D7W5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Med8Q9D7W5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Med8Q9D7W5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Med8Q9D7W5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Med8Q9D7W5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Med8Q9D7W5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Med8Q9D7W5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Med8Q9D7W5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Med8Q9D7W5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Med8Q9D7W5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Med8Q9D7W5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Med8Q9D7W5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Med8Q9D7W5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Med8Q9D7W5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Med8Q9D7W5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Med8Q9D7W5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Med8Q9D7W5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Med8Q9D7W5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Med8Q9D7W5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Med8Q9D7W5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Med8Q9D7W5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Med8Q9D7W5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms