Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L5

2310002L09Rik, RIKEN cDNA 2310002L09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2310002L09RikQ9D7L5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
2310002L09RikQ9D7L5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
2310002L09RikQ9D7L5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
2310002L09RikQ9D7L5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
2310002L09RikQ9D7L5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
2310002L09RikQ9D7L5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
2310002L09RikQ9D7L5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
2310002L09RikQ9D7L5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
2310002L09RikQ9D7L5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
2310002L09RikQ9D7L5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
2310002L09RikQ9D7L5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
2310002L09RikQ9D7L5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
2310002L09RikQ9D7L5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
2310002L09RikQ9D7L5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
2310002L09RikQ9D7L5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
2310002L09RikQ9D7L5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
2310002L09RikQ9D7L5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
2310002L09RikQ9D7L5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
2310002L09RikQ9D7L5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
2310002L09RikQ9D7L5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
2310002L09RikQ9D7L5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
2310002L09RikQ9D7L5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
2310002L09RikQ9D7L5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
2310002L09RikQ9D7L5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
2310002L09RikQ9D7L5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
2310002L09RikQ9D7L5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
2310002L09RikQ9D7L5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
2310002L09RikQ9D7L5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
2310002L09RikQ9D7L5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
2310002L09RikQ9D7L5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
2310002L09RikQ9D7L5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
2310002L09RikQ9D7L5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
2310002L09RikQ9D7L5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
2310002L09RikQ9D7L5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
2310002L09RikQ9D7L5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
2310002L09RikQ9D7L5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
2310002L09RikQ9D7L5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
2310002L09RikQ9D7L5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
2310002L09RikQ9D7L5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
2310002L09RikQ9D7L5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
2310002L09RikQ9D7L5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
2310002L09RikQ9D7L5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
2310002L09RikQ9D7L5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
2310002L09RikQ9D7L5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
2310002L09RikQ9D7L5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
2310002L09RikQ9D7L5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
2310002L09RikQ9D7L5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
2310002L09RikQ9D7L5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
2310002L09RikQ9D7L5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
2310002L09RikQ9D7L5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
2310002L09RikQ9D7L5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
2310002L09RikQ9D7L5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
2310002L09RikQ9D7L5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
2310002L09RikQ9D7L5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
2310002L09RikQ9D7L5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
2310002L09RikQ9D7L5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
2310002L09RikQ9D7L5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
2310002L09RikQ9D7L5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
2310002L09RikQ9D7L5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
2310002L09RikQ9D7L5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
2310002L09RikQ9D7L5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
2310002L09RikQ9D7L5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
2310002L09RikQ9D7L5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
2310002L09RikQ9D7L5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
2310002L09RikQ9D7L5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
2310002L09RikQ9D7L5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
2310002L09RikQ9D7L5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
2310002L09RikQ9D7L5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
2310002L09RikQ9D7L5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
2310002L09RikQ9D7L5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
2310002L09RikQ9D7L5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
2310002L09RikQ9D7L5 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
2310002L09RikQ9D7L5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
2310002L09RikQ9D7L5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
2310002L09RikQ9D7L5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
2310002L09RikQ9D7L5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
2310002L09RikQ9D7L5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
2310002L09RikQ9D7L5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
2310002L09RikQ9D7L5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
2310002L09RikQ9D7L5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
2310002L09RikQ9D7L5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
2310002L09RikQ9D7L5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
2310002L09RikQ9D7L5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
2310002L09RikQ9D7L5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
2310002L09RikQ9D7L5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
2310002L09RikQ9D7L5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
2310002L09RikQ9D7L5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
2310002L09RikQ9D7L5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
2310002L09RikQ9D7L5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
2310002L09RikQ9D7L5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
2310002L09RikQ9D7L5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
2310002L09RikQ9D7L5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
2310002L09RikQ9D7L5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
2310002L09RikQ9D7L5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
2310002L09RikQ9D7L5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
2310002L09RikQ9D7L5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
2310002L09RikQ9D7L5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
2310002L09RikQ9D7L5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
2310002L09RikQ9D7L5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
2310002L09RikQ9D7L5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms