Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Chmp4cQ9D7F7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Chmp4cQ9D7F7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Chmp4cQ9D7F7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Chmp4cQ9D7F7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Chmp4cQ9D7F7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Chmp4cQ9D7F7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Chmp4cQ9D7F7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Chmp4cQ9D7F7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Chmp4cQ9D7F7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Chmp4cQ9D7F7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Chmp4cQ9D7F7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Chmp4cQ9D7F7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Chmp4cQ9D7F7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Chmp4cQ9D7F7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Chmp4cQ9D7F7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Chmp4cQ9D7F7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Chmp4cQ9D7F7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Chmp4cQ9D7F7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Chmp4cQ9D7F7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Chmp4cQ9D7F7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Chmp4cQ9D7F7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Chmp4cQ9D7F7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Chmp4cQ9D7F7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Chmp4cQ9D7F7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Chmp4cQ9D7F7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Chmp4cQ9D7F7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Chmp4cQ9D7F7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Chmp4cQ9D7F7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Chmp4cQ9D7F7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Chmp4cQ9D7F7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Chmp4cQ9D7F7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Chmp4cQ9D7F7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Chmp4cQ9D7F7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Chmp4cQ9D7F7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Chmp4cQ9D7F7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Chmp4cQ9D7F7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Chmp4cQ9D7F7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Chmp4cQ9D7F7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Chmp4cQ9D7F7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Chmp4cQ9D7F7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Chmp4cQ9D7F7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Chmp4cQ9D7F7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Chmp4cQ9D7F7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Chmp4cQ9D7F7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Chmp4cQ9D7F7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Chmp4cQ9D7F7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Chmp4cQ9D7F7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Chmp4cQ9D7F7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Chmp4cQ9D7F7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Chmp4cQ9D7F7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Chmp4cQ9D7F7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Chmp4cQ9D7F7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Chmp4cQ9D7F7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Chmp4cQ9D7F7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Chmp4cQ9D7F7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Chmp4cQ9D7F7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Chmp4cQ9D7F7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Chmp4cQ9D7F7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Chmp4cQ9D7F7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Chmp4cQ9D7F7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Chmp4cQ9D7F7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Chmp4cQ9D7F7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Chmp4cQ9D7F7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Chmp4cQ9D7F7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Chmp4cQ9D7F7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Chmp4cQ9D7F7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Chmp4cQ9D7F7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Chmp4cQ9D7F7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Chmp4cQ9D7F7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Chmp4cQ9D7F7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Chmp4cQ9D7F7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Chmp4cQ9D7F7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Chmp4cQ9D7F7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Chmp4cQ9D7F7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Chmp4cQ9D7F7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Chmp4cQ9D7F7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Chmp4cQ9D7F7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Chmp4cQ9D7F7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Chmp4cQ9D7F7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Chmp4cQ9D7F7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Chmp4cQ9D7F7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Chmp4cQ9D7F7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Chmp4cQ9D7F7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Chmp4cQ9D7F7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Chmp4cQ9D7F7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Chmp4cQ9D7F7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Chmp4cQ9D7F7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Chmp4cQ9D7F7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Chmp4cQ9D7F7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Chmp4cQ9D7F7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Chmp4cQ9D7F7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Chmp4cQ9D7F7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Chmp4cQ9D7F7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Chmp4cQ9D7F7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Chmp4cQ9D7F7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Chmp4cQ9D7F7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Chmp4cQ9D7F7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Chmp4cQ9D7F7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Chmp4cQ9D7F7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.7 ms