Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y9

Gbe1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbe1Q9D6Y9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gbe1Q9D6Y9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gbe1Q9D6Y9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gbe1Q9D6Y9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gbe1Q9D6Y9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gbe1Q9D6Y9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gbe1Q9D6Y9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gbe1Q9D6Y9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gbe1Q9D6Y9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gbe1Q9D6Y9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gbe1Q9D6Y9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gbe1Q9D6Y9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gbe1Q9D6Y9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gbe1Q9D6Y9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gbe1Q9D6Y9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gbe1Q9D6Y9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gbe1Q9D6Y9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gbe1Q9D6Y9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gbe1Q9D6Y9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gbe1Q9D6Y9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Gbe1Q9D6Y9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gbe1Q9D6Y9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gbe1Q9D6Y9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gbe1Q9D6Y9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gbe1Q9D6Y9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gbe1Q9D6Y9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gbe1Q9D6Y9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gbe1Q9D6Y9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gbe1Q9D6Y9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gbe1Q9D6Y9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gbe1Q9D6Y9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gbe1Q9D6Y9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gbe1Q9D6Y9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gbe1Q9D6Y9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gbe1Q9D6Y9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gbe1Q9D6Y9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gbe1Q9D6Y9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gbe1Q9D6Y9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gbe1Q9D6Y9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gbe1Q9D6Y9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gbe1Q9D6Y9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gbe1Q9D6Y9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gbe1Q9D6Y9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gbe1Q9D6Y9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gbe1Q9D6Y9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gbe1Q9D6Y9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gbe1Q9D6Y9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Gbe1Q9D6Y9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gbe1Q9D6Y9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gbe1Q9D6Y9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gbe1Q9D6Y9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gbe1Q9D6Y9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gbe1Q9D6Y9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gbe1Q9D6Y9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gbe1Q9D6Y9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gbe1Q9D6Y9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gbe1Q9D6Y9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gbe1Q9D6Y9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gbe1Q9D6Y9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gbe1Q9D6Y9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gbe1Q9D6Y9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gbe1Q9D6Y9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Gbe1Q9D6Y9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gbe1Q9D6Y9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gbe1Q9D6Y9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gbe1Q9D6Y9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gbe1Q9D6Y9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Gbe1Q9D6Y9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gbe1Q9D6Y9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gbe1Q9D6Y9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gbe1Q9D6Y9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gbe1Q9D6Y9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gbe1Q9D6Y9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gbe1Q9D6Y9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gbe1Q9D6Y9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gbe1Q9D6Y9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gbe1Q9D6Y9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gbe1Q9D6Y9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gbe1Q9D6Y9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gbe1Q9D6Y9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gbe1Q9D6Y9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gbe1Q9D6Y9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gbe1Q9D6Y9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gbe1Q9D6Y9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gbe1Q9D6Y9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Gbe1Q9D6Y9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Gbe1Q9D6Y9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gbe1Q9D6Y9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gbe1Q9D6Y9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gbe1Q9D6Y9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Gbe1Q9D6Y9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gbe1Q9D6Y9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gbe1Q9D6Y9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Gbe1Q9D6Y9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gbe1Q9D6Y9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gbe1Q9D6Y9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gbe1Q9D6Y9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gbe1Q9D6Y9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gbe1Q9D6Y9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gbe1Q9D6Y9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms