Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q8

Uncharacterized protein C1orf141 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D5Q8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Q9D5Q8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Q9D5Q8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Q9D5Q8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Q9D5Q8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Q9D5Q8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Q9D5Q8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Q9D5Q8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Q9D5Q8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Q9D5Q8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Q9D5Q8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Q9D5Q8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Q9D5Q8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Q9D5Q8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Q9D5Q8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Q9D5Q8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Q9D5Q8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Q9D5Q8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Q9D5Q8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Q9D5Q8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Q9D5Q8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Q9D5Q8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Q9D5Q8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Q9D5Q8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Q9D5Q8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Q9D5Q8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Q9D5Q8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Q9D5Q8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Q9D5Q8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Q9D5Q8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Q9D5Q8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Q9D5Q8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Q9D5Q8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Q9D5Q8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Q9D5Q8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Q9D5Q8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Q9D5Q8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Q9D5Q8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Q9D5Q8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Q9D5Q8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Q9D5Q8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Q9D5Q8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Q9D5Q8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Q9D5Q8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Q9D5Q8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Q9D5Q8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Q9D5Q8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Q9D5Q8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Q9D5Q8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Q9D5Q8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Q9D5Q8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Q9D5Q8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Q9D5Q8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Q9D5Q8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Q9D5Q8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Q9D5Q8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Q9D5Q8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Q9D5Q8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Q9D5Q8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Q9D5Q8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Q9D5Q8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Q9D5Q8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Q9D5Q8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Q9D5Q8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Q9D5Q8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Q9D5Q8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Q9D5Q8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Q9D5Q8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Q9D5Q8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Q9D5Q8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Q9D5Q8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Q9D5Q8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Q9D5Q8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Q9D5Q8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Q9D5Q8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Q9D5Q8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Q9D5Q8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Q9D5Q8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Q9D5Q8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Q9D5Q8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Q9D5Q8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Q9D5Q8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Q9D5Q8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Q9D5Q8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Q9D5Q8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Q9D5Q8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Q9D5Q8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Q9D5Q8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Q9D5Q8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Q9D5Q8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Q9D5Q8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Q9D5Q8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Q9D5Q8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Q9D5Q8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Q9D5Q8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Q9D5Q8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Q9D5Q8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Q9D5Q8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Q9D5Q8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Q9D5Q8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms