Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Lonrf3Q9D4H7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Lonrf3Q9D4H7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Lonrf3Q9D4H7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Lonrf3Q9D4H7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Lonrf3Q9D4H7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Lonrf3Q9D4H7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Lonrf3Q9D4H7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Lonrf3Q9D4H7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Lonrf3Q9D4H7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Lonrf3Q9D4H7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Lonrf3Q9D4H7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Lonrf3Q9D4H7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Lonrf3Q9D4H7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Lonrf3Q9D4H7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Lonrf3Q9D4H7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Lonrf3Q9D4H7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Lonrf3Q9D4H7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Lonrf3Q9D4H7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Lonrf3Q9D4H7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Lonrf3Q9D4H7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lonrf3Q9D4H7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Lonrf3Q9D4H7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lonrf3Q9D4H7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lonrf3Q9D4H7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lonrf3Q9D4H7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Lonrf3Q9D4H7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Lonrf3Q9D4H7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Lonrf3Q9D4H7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Lonrf3Q9D4H7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Lonrf3Q9D4H7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Lonrf3Q9D4H7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Lonrf3Q9D4H7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Lonrf3Q9D4H7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Lonrf3Q9D4H7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Lonrf3Q9D4H7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Lonrf3Q9D4H7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Lonrf3Q9D4H7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Lonrf3Q9D4H7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Lonrf3Q9D4H7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Lonrf3Q9D4H7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Lonrf3Q9D4H7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Lonrf3Q9D4H7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Lonrf3Q9D4H7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Lonrf3Q9D4H7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Lonrf3Q9D4H7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Lonrf3Q9D4H7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Lonrf3Q9D4H7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Lonrf3Q9D4H7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Lonrf3Q9D4H7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Lonrf3Q9D4H7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Lonrf3Q9D4H7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Lonrf3Q9D4H7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Lonrf3Q9D4H7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Lonrf3Q9D4H7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Lonrf3Q9D4H7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Lonrf3Q9D4H7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Lonrf3Q9D4H7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Lonrf3Q9D4H7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Lonrf3Q9D4H7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Lonrf3Q9D4H7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Lonrf3Q9D4H7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Lonrf3Q9D4H7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Lonrf3Q9D4H7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Lonrf3Q9D4H7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Lonrf3Q9D4H7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
Lonrf3Q9D4H7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Lonrf3Q9D4H7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Lonrf3Q9D4H7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Lonrf3Q9D4H7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Lonrf3Q9D4H7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Lonrf3Q9D4H7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Lonrf3Q9D4H7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Lonrf3Q9D4H7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Lonrf3Q9D4H7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Lonrf3Q9D4H7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Lonrf3Q9D4H7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Lonrf3Q9D4H7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Lonrf3Q9D4H7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Lonrf3Q9D4H7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Lonrf3Q9D4H7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Lonrf3Q9D4H7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Lonrf3Q9D4H7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Lonrf3Q9D4H7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Lonrf3Q9D4H7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Lonrf3Q9D4H7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Lonrf3Q9D4H7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Lonrf3Q9D4H7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Lonrf3Q9D4H7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Lonrf3Q9D4H7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Lonrf3Q9D4H7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Lonrf3Q9D4H7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Lonrf3Q9D4H7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Lonrf3Q9D4H7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Lonrf3Q9D4H7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Lonrf3Q9D4H7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Lonrf3Q9D4H7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Lonrf3Q9D4H7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Lonrf3Q9D4H7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Lonrf3Q9D4H7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 156.2 ms