Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4E6

Pabpc6, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc6Q9D4E6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Pabpc6Q9D4E6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pabpc6Q9D4E6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pabpc6Q9D4E6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pabpc6Q9D4E6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pabpc6Q9D4E6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pabpc6Q9D4E6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pabpc6Q9D4E6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pabpc6Q9D4E6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Pabpc6Q9D4E6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Pabpc6Q9D4E6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pabpc6Q9D4E6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pabpc6Q9D4E6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pabpc6Q9D4E6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pabpc6Q9D4E6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pabpc6Q9D4E6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pabpc6Q9D4E6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pabpc6Q9D4E6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pabpc6Q9D4E6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pabpc6Q9D4E6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pabpc6Q9D4E6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Pabpc6Q9D4E6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pabpc6Q9D4E6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pabpc6Q9D4E6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pabpc6Q9D4E6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pabpc6Q9D4E6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Pabpc6Q9D4E6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pabpc6Q9D4E6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pabpc6Q9D4E6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pabpc6Q9D4E6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pabpc6Q9D4E6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pabpc6Q9D4E6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pabpc6Q9D4E6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pabpc6Q9D4E6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pabpc6Q9D4E6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pabpc6Q9D4E6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pabpc6Q9D4E6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pabpc6Q9D4E6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Pabpc6Q9D4E6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pabpc6Q9D4E6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pabpc6Q9D4E6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pabpc6Q9D4E6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pabpc6Q9D4E6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Pabpc6Q9D4E6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pabpc6Q9D4E6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pabpc6Q9D4E6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pabpc6Q9D4E6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Pabpc6Q9D4E6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pabpc6Q9D4E6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pabpc6Q9D4E6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pabpc6Q9D4E6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pabpc6Q9D4E6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pabpc6Q9D4E6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pabpc6Q9D4E6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pabpc6Q9D4E6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pabpc6Q9D4E6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pabpc6Q9D4E6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pabpc6Q9D4E6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pabpc6Q9D4E6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pabpc6Q9D4E6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Pabpc6Q9D4E6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pabpc6Q9D4E6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pabpc6Q9D4E6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pabpc6Q9D4E6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pabpc6Q9D4E6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pabpc6Q9D4E6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pabpc6Q9D4E6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Pabpc6Q9D4E6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pabpc6Q9D4E6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pabpc6Q9D4E6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pabpc6Q9D4E6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pabpc6Q9D4E6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pabpc6Q9D4E6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pabpc6Q9D4E6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pabpc6Q9D4E6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pabpc6Q9D4E6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pabpc6Q9D4E6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pabpc6Q9D4E6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pabpc6Q9D4E6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pabpc6Q9D4E6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pabpc6Q9D4E6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pabpc6Q9D4E6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pabpc6Q9D4E6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pabpc6Q9D4E6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pabpc6Q9D4E6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pabpc6Q9D4E6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pabpc6Q9D4E6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pabpc6Q9D4E6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pabpc6Q9D4E6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pabpc6Q9D4E6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pabpc6Q9D4E6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pabpc6Q9D4E6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pabpc6Q9D4E6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pabpc6Q9D4E6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pabpc6Q9D4E6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pabpc6Q9D4E6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pabpc6Q9D4E6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pabpc6Q9D4E6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pabpc6Q9D4E6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pabpc6Q9D4E6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms