Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4D5

4933414I15Rik, RIKEN cDNA 4933414I15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933414I15RikQ9D4D5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4933414I15RikQ9D4D5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
4933414I15RikQ9D4D5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
4933414I15RikQ9D4D5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4933414I15RikQ9D4D5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
4933414I15RikQ9D4D5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4933414I15RikQ9D4D5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4933414I15RikQ9D4D5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
4933414I15RikQ9D4D5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4933414I15RikQ9D4D5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4933414I15RikQ9D4D5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4933414I15RikQ9D4D5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4933414I15RikQ9D4D5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
4933414I15RikQ9D4D5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4933414I15RikQ9D4D5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
4933414I15RikQ9D4D5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
4933414I15RikQ9D4D5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4933414I15RikQ9D4D5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4933414I15RikQ9D4D5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4933414I15RikQ9D4D5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
4933414I15RikQ9D4D5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
4933414I15RikQ9D4D5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4933414I15RikQ9D4D5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4933414I15RikQ9D4D5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
4933414I15RikQ9D4D5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
4933414I15RikQ9D4D5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4933414I15RikQ9D4D5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4933414I15RikQ9D4D5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4933414I15RikQ9D4D5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4933414I15RikQ9D4D5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4933414I15RikQ9D4D5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4933414I15RikQ9D4D5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4933414I15RikQ9D4D5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4933414I15RikQ9D4D5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4933414I15RikQ9D4D5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4933414I15RikQ9D4D5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
4933414I15RikQ9D4D5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
4933414I15RikQ9D4D5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
4933414I15RikQ9D4D5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4933414I15RikQ9D4D5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4933414I15RikQ9D4D5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4933414I15RikQ9D4D5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4933414I15RikQ9D4D5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4933414I15RikQ9D4D5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
4933414I15RikQ9D4D5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
4933414I15RikQ9D4D5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
4933414I15RikQ9D4D5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4933414I15RikQ9D4D5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4933414I15RikQ9D4D5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4933414I15RikQ9D4D5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4933414I15RikQ9D4D5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4933414I15RikQ9D4D5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
4933414I15RikQ9D4D5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
4933414I15RikQ9D4D5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4933414I15RikQ9D4D5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4933414I15RikQ9D4D5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4933414I15RikQ9D4D5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4933414I15RikQ9D4D5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
4933414I15RikQ9D4D5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4933414I15RikQ9D4D5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4933414I15RikQ9D4D5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4933414I15RikQ9D4D5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
4933414I15RikQ9D4D5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4933414I15RikQ9D4D5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4933414I15RikQ9D4D5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4933414I15RikQ9D4D5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
4933414I15RikQ9D4D5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4933414I15RikQ9D4D5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4933414I15RikQ9D4D5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4933414I15RikQ9D4D5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4933414I15RikQ9D4D5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4933414I15RikQ9D4D5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4933414I15RikQ9D4D5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4933414I15RikQ9D4D5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4933414I15RikQ9D4D5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4933414I15RikQ9D4D5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4933414I15RikQ9D4D5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4933414I15RikQ9D4D5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4933414I15RikQ9D4D5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4933414I15RikQ9D4D5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
4933414I15RikQ9D4D5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
4933414I15RikQ9D4D5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4933414I15RikQ9D4D5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
4933414I15RikQ9D4D5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4933414I15RikQ9D4D5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
4933414I15RikQ9D4D5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
4933414I15RikQ9D4D5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4933414I15RikQ9D4D5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4933414I15RikQ9D4D5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
4933414I15RikQ9D4D5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4933414I15RikQ9D4D5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4933414I15RikQ9D4D5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4933414I15RikQ9D4D5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4933414I15RikQ9D4D5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4933414I15RikQ9D4D5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
4933414I15RikQ9D4D5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4933414I15RikQ9D4D5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4933414I15RikQ9D4D5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4933414I15RikQ9D4D5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4933414I15RikQ9D4D5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms