Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3U0

Pus10, Putative tRNA pseudouridine synthase Pus10, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus10Q9D3U0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pus10Q9D3U0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pus10Q9D3U0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pus10Q9D3U0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pus10Q9D3U0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pus10Q9D3U0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pus10Q9D3U0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pus10Q9D3U0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pus10Q9D3U0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pus10Q9D3U0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pus10Q9D3U0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pus10Q9D3U0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pus10Q9D3U0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pus10Q9D3U0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pus10Q9D3U0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pus10Q9D3U0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pus10Q9D3U0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pus10Q9D3U0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pus10Q9D3U0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pus10Q9D3U0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pus10Q9D3U0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pus10Q9D3U0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pus10Q9D3U0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pus10Q9D3U0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pus10Q9D3U0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pus10Q9D3U0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pus10Q9D3U0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pus10Q9D3U0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pus10Q9D3U0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Pus10Q9D3U0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Pus10Q9D3U0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pus10Q9D3U0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pus10Q9D3U0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pus10Q9D3U0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pus10Q9D3U0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pus10Q9D3U0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pus10Q9D3U0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pus10Q9D3U0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Pus10Q9D3U0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pus10Q9D3U0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pus10Q9D3U0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Pus10Q9D3U0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pus10Q9D3U0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pus10Q9D3U0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pus10Q9D3U0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pus10Q9D3U0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pus10Q9D3U0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pus10Q9D3U0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pus10Q9D3U0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pus10Q9D3U0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pus10Q9D3U0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pus10Q9D3U0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pus10Q9D3U0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pus10Q9D3U0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pus10Q9D3U0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Pus10Q9D3U0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Pus10Q9D3U0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pus10Q9D3U0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Pus10Q9D3U0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pus10Q9D3U0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pus10Q9D3U0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pus10Q9D3U0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pus10Q9D3U0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pus10Q9D3U0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pus10Q9D3U0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pus10Q9D3U0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pus10Q9D3U0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pus10Q9D3U0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pus10Q9D3U0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pus10Q9D3U0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pus10Q9D3U0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pus10Q9D3U0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pus10Q9D3U0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Pus10Q9D3U0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pus10Q9D3U0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pus10Q9D3U0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pus10Q9D3U0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pus10Q9D3U0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pus10Q9D3U0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pus10Q9D3U0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pus10Q9D3U0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pus10Q9D3U0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Pus10Q9D3U0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Pus10Q9D3U0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pus10Q9D3U0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pus10Q9D3U0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Pus10Q9D3U0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pus10Q9D3U0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pus10Q9D3U0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pus10Q9D3U0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pus10Q9D3U0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pus10Q9D3U0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pus10Q9D3U0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pus10Q9D3U0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pus10Q9D3U0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Pus10Q9D3U0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pus10Q9D3U0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pus10Q9D3U0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pus10Q9D3U0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pus10Q9D3U0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms