Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3R6

Katnal2, Katanin p60 ATPase-containing subunit A-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Katnal2Q9D3R6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Katnal2Q9D3R6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Katnal2Q9D3R6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Katnal2Q9D3R6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Katnal2Q9D3R6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Katnal2Q9D3R6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Katnal2Q9D3R6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Katnal2Q9D3R6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Katnal2Q9D3R6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Katnal2Q9D3R6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Katnal2Q9D3R6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Katnal2Q9D3R6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Katnal2Q9D3R6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Katnal2Q9D3R6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Katnal2Q9D3R6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Katnal2Q9D3R6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Katnal2Q9D3R6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Katnal2Q9D3R6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Katnal2Q9D3R6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Katnal2Q9D3R6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Katnal2Q9D3R6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Katnal2Q9D3R6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Katnal2Q9D3R6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Katnal2Q9D3R6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Katnal2Q9D3R6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Katnal2Q9D3R6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Katnal2Q9D3R6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Katnal2Q9D3R6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Katnal2Q9D3R6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Katnal2Q9D3R6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Katnal2Q9D3R6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Katnal2Q9D3R6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Katnal2Q9D3R6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Katnal2Q9D3R6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Katnal2Q9D3R6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Katnal2Q9D3R6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Katnal2Q9D3R6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Katnal2Q9D3R6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Katnal2Q9D3R6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Katnal2Q9D3R6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Katnal2Q9D3R6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Katnal2Q9D3R6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Katnal2Q9D3R6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Katnal2Q9D3R6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Katnal2Q9D3R6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Katnal2Q9D3R6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Katnal2Q9D3R6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Katnal2Q9D3R6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Katnal2Q9D3R6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Katnal2Q9D3R6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Katnal2Q9D3R6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Katnal2Q9D3R6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Katnal2Q9D3R6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Katnal2Q9D3R6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Katnal2Q9D3R6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Katnal2Q9D3R6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Katnal2Q9D3R6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Katnal2Q9D3R6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Katnal2Q9D3R6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Katnal2Q9D3R6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Katnal2Q9D3R6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Katnal2Q9D3R6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Katnal2Q9D3R6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Katnal2Q9D3R6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Katnal2Q9D3R6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Katnal2Q9D3R6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Katnal2Q9D3R6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Katnal2Q9D3R6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Katnal2Q9D3R6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Katnal2Q9D3R6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Katnal2Q9D3R6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Katnal2Q9D3R6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Katnal2Q9D3R6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Katnal2Q9D3R6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Katnal2Q9D3R6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Katnal2Q9D3R6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Katnal2Q9D3R6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Katnal2Q9D3R6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Katnal2Q9D3R6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Katnal2Q9D3R6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Katnal2Q9D3R6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Katnal2Q9D3R6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Katnal2Q9D3R6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Katnal2Q9D3R6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Katnal2Q9D3R6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Katnal2Q9D3R6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Katnal2Q9D3R6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Katnal2Q9D3R6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Katnal2Q9D3R6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Katnal2Q9D3R6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Katnal2Q9D3R6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Katnal2Q9D3R6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Katnal2Q9D3R6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Katnal2Q9D3R6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Katnal2Q9D3R6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Katnal2Q9D3R6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Katnal2Q9D3R6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Katnal2Q9D3R6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Katnal2Q9D3R6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Katnal2Q9D3R6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms