Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2T6

1700034E13Rik, RIKEN cDNA 1700034E13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700034E13RikQ9D2T6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
1700034E13RikQ9D2T6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
1700034E13RikQ9D2T6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
1700034E13RikQ9D2T6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
1700034E13RikQ9D2T6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
1700034E13RikQ9D2T6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
1700034E13RikQ9D2T6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
1700034E13RikQ9D2T6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
1700034E13RikQ9D2T6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
1700034E13RikQ9D2T6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
1700034E13RikQ9D2T6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
1700034E13RikQ9D2T6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
1700034E13RikQ9D2T6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
1700034E13RikQ9D2T6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
1700034E13RikQ9D2T6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
1700034E13RikQ9D2T6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
1700034E13RikQ9D2T6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
1700034E13RikQ9D2T6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
1700034E13RikQ9D2T6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
1700034E13RikQ9D2T6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
1700034E13RikQ9D2T6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
1700034E13RikQ9D2T6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
1700034E13RikQ9D2T6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
1700034E13RikQ9D2T6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
1700034E13RikQ9D2T6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
1700034E13RikQ9D2T6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
1700034E13RikQ9D2T6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
1700034E13RikQ9D2T6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
1700034E13RikQ9D2T6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
1700034E13RikQ9D2T6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
1700034E13RikQ9D2T6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
1700034E13RikQ9D2T6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
1700034E13RikQ9D2T6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
1700034E13RikQ9D2T6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
1700034E13RikQ9D2T6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
1700034E13RikQ9D2T6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
1700034E13RikQ9D2T6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20■□□□□ 0.79
1700034E13RikQ9D2T6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
1700034E13RikQ9D2T6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
1700034E13RikQ9D2T6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
1700034E13RikQ9D2T6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
1700034E13RikQ9D2T6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
1700034E13RikQ9D2T6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
1700034E13RikQ9D2T6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
1700034E13RikQ9D2T6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
1700034E13RikQ9D2T6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
1700034E13RikQ9D2T6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
1700034E13RikQ9D2T6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
1700034E13RikQ9D2T6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
1700034E13RikQ9D2T6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
1700034E13RikQ9D2T6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
1700034E13RikQ9D2T6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
1700034E13RikQ9D2T6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
1700034E13RikQ9D2T6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
1700034E13RikQ9D2T6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
1700034E13RikQ9D2T6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
1700034E13RikQ9D2T6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
1700034E13RikQ9D2T6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
1700034E13RikQ9D2T6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
1700034E13RikQ9D2T6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
1700034E13RikQ9D2T6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
1700034E13RikQ9D2T6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
1700034E13RikQ9D2T6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
1700034E13RikQ9D2T6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
1700034E13RikQ9D2T6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
1700034E13RikQ9D2T6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
1700034E13RikQ9D2T6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
1700034E13RikQ9D2T6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
1700034E13RikQ9D2T6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
1700034E13RikQ9D2T6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
1700034E13RikQ9D2T6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
1700034E13RikQ9D2T6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
1700034E13RikQ9D2T6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
1700034E13RikQ9D2T6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
1700034E13RikQ9D2T6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
1700034E13RikQ9D2T6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
1700034E13RikQ9D2T6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
1700034E13RikQ9D2T6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
1700034E13RikQ9D2T6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
1700034E13RikQ9D2T6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
1700034E13RikQ9D2T6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
1700034E13RikQ9D2T6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
1700034E13RikQ9D2T6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
1700034E13RikQ9D2T6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
1700034E13RikQ9D2T6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
1700034E13RikQ9D2T6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
1700034E13RikQ9D2T6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
1700034E13RikQ9D2T6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
1700034E13RikQ9D2T6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
1700034E13RikQ9D2T6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
1700034E13RikQ9D2T6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
1700034E13RikQ9D2T6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
1700034E13RikQ9D2T6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
1700034E13RikQ9D2T6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
1700034E13RikQ9D2T6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
1700034E13RikQ9D2T6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
1700034E13RikQ9D2T6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
1700034E13RikQ9D2T6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
1700034E13RikQ9D2T6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
1700034E13RikQ9D2T6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms