Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0I8

Mrto4, mRNA turnover protein 4 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrto4Q9D0I8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Mrto4Q9D0I8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Mrto4Q9D0I8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Mrto4Q9D0I8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Mrto4Q9D0I8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Mrto4Q9D0I8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mrto4Q9D0I8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mrto4Q9D0I8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mrto4Q9D0I8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mrto4Q9D0I8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mrto4Q9D0I8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mrto4Q9D0I8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mrto4Q9D0I8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mrto4Q9D0I8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mrto4Q9D0I8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mrto4Q9D0I8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mrto4Q9D0I8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mrto4Q9D0I8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mrto4Q9D0I8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mrto4Q9D0I8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mrto4Q9D0I8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mrto4Q9D0I8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mrto4Q9D0I8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mrto4Q9D0I8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mrto4Q9D0I8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mrto4Q9D0I8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mrto4Q9D0I8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mrto4Q9D0I8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Mrto4Q9D0I8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Mrto4Q9D0I8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mrto4Q9D0I8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mrto4Q9D0I8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mrto4Q9D0I8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mrto4Q9D0I8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mrto4Q9D0I8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mrto4Q9D0I8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mrto4Q9D0I8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mrto4Q9D0I8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mrto4Q9D0I8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mrto4Q9D0I8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mrto4Q9D0I8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mrto4Q9D0I8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mrto4Q9D0I8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mrto4Q9D0I8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mrto4Q9D0I8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mrto4Q9D0I8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mrto4Q9D0I8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mrto4Q9D0I8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mrto4Q9D0I8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mrto4Q9D0I8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mrto4Q9D0I8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Mrto4Q9D0I8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Mrto4Q9D0I8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mrto4Q9D0I8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mrto4Q9D0I8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mrto4Q9D0I8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mrto4Q9D0I8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mrto4Q9D0I8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mrto4Q9D0I8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mrto4Q9D0I8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mrto4Q9D0I8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mrto4Q9D0I8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mrto4Q9D0I8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mrto4Q9D0I8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mrto4Q9D0I8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mrto4Q9D0I8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mrto4Q9D0I8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mrto4Q9D0I8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mrto4Q9D0I8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mrto4Q9D0I8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mrto4Q9D0I8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mrto4Q9D0I8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mrto4Q9D0I8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mrto4Q9D0I8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mrto4Q9D0I8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mrto4Q9D0I8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mrto4Q9D0I8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mrto4Q9D0I8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mrto4Q9D0I8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mrto4Q9D0I8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Mrto4Q9D0I8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mrto4Q9D0I8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mrto4Q9D0I8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mrto4Q9D0I8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mrto4Q9D0I8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mrto4Q9D0I8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mrto4Q9D0I8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mrto4Q9D0I8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mrto4Q9D0I8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mrto4Q9D0I8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mrto4Q9D0I8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mrto4Q9D0I8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mrto4Q9D0I8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mrto4Q9D0I8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mrto4Q9D0I8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mrto4Q9D0I8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mrto4Q9D0I8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mrto4Q9D0I8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mrto4Q9D0I8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mrto4Q9D0I8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms