Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZU9

2610524H06Rik, RIKEN cDNA 2610524H06, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610524H06RikQ9CZU9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
2610524H06RikQ9CZU9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
2610524H06RikQ9CZU9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
2610524H06RikQ9CZU9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
2610524H06RikQ9CZU9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
2610524H06RikQ9CZU9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
2610524H06RikQ9CZU9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
2610524H06RikQ9CZU9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
2610524H06RikQ9CZU9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
2610524H06RikQ9CZU9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
2610524H06RikQ9CZU9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
2610524H06RikQ9CZU9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
2610524H06RikQ9CZU9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
2610524H06RikQ9CZU9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
2610524H06RikQ9CZU9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
2610524H06RikQ9CZU9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
2610524H06RikQ9CZU9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
2610524H06RikQ9CZU9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
2610524H06RikQ9CZU9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
2610524H06RikQ9CZU9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
2610524H06RikQ9CZU9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
2610524H06RikQ9CZU9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
2610524H06RikQ9CZU9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
2610524H06RikQ9CZU9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
2610524H06RikQ9CZU9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
2610524H06RikQ9CZU9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
2610524H06RikQ9CZU9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
2610524H06RikQ9CZU9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
2610524H06RikQ9CZU9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
2610524H06RikQ9CZU9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
2610524H06RikQ9CZU9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
2610524H06RikQ9CZU9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
2610524H06RikQ9CZU9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
2610524H06RikQ9CZU9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
2610524H06RikQ9CZU9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
2610524H06RikQ9CZU9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
2610524H06RikQ9CZU9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
2610524H06RikQ9CZU9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
2610524H06RikQ9CZU9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
2610524H06RikQ9CZU9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
2610524H06RikQ9CZU9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
2610524H06RikQ9CZU9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
2610524H06RikQ9CZU9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
2610524H06RikQ9CZU9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
2610524H06RikQ9CZU9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
2610524H06RikQ9CZU9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
2610524H06RikQ9CZU9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
2610524H06RikQ9CZU9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
2610524H06RikQ9CZU9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
2610524H06RikQ9CZU9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
2610524H06RikQ9CZU9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
2610524H06RikQ9CZU9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
2610524H06RikQ9CZU9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
2610524H06RikQ9CZU9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
2610524H06RikQ9CZU9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
2610524H06RikQ9CZU9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
2610524H06RikQ9CZU9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
2610524H06RikQ9CZU9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
2610524H06RikQ9CZU9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
2610524H06RikQ9CZU9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
2610524H06RikQ9CZU9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
2610524H06RikQ9CZU9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
2610524H06RikQ9CZU9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
2610524H06RikQ9CZU9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
2610524H06RikQ9CZU9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
2610524H06RikQ9CZU9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
2610524H06RikQ9CZU9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
2610524H06RikQ9CZU9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
2610524H06RikQ9CZU9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
2610524H06RikQ9CZU9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
2610524H06RikQ9CZU9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
2610524H06RikQ9CZU9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
2610524H06RikQ9CZU9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
2610524H06RikQ9CZU9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
2610524H06RikQ9CZU9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
2610524H06RikQ9CZU9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
2610524H06RikQ9CZU9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
2610524H06RikQ9CZU9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
2610524H06RikQ9CZU9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
2610524H06RikQ9CZU9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
2610524H06RikQ9CZU9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
2610524H06RikQ9CZU9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
2610524H06RikQ9CZU9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
2610524H06RikQ9CZU9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
2610524H06RikQ9CZU9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
2610524H06RikQ9CZU9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
2610524H06RikQ9CZU9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
2610524H06RikQ9CZU9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
2610524H06RikQ9CZU9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
2610524H06RikQ9CZU9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
2610524H06RikQ9CZU9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
2610524H06RikQ9CZU9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
2610524H06RikQ9CZU9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
2610524H06RikQ9CZU9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
2610524H06RikQ9CZU9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
2610524H06RikQ9CZU9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
2610524H06RikQ9CZU9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
2610524H06RikQ9CZU9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
2610524H06RikQ9CZU9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
2610524H06RikQ9CZU9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms