Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN4

Shisa9, Protein shisa-9, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa9Q9CZN4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Shisa9Q9CZN4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Shisa9Q9CZN4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Shisa9Q9CZN4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Shisa9Q9CZN4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Shisa9Q9CZN4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Shisa9Q9CZN4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Shisa9Q9CZN4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Shisa9Q9CZN4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Shisa9Q9CZN4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Shisa9Q9CZN4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Shisa9Q9CZN4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Shisa9Q9CZN4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Shisa9Q9CZN4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Shisa9Q9CZN4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Shisa9Q9CZN4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Shisa9Q9CZN4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Shisa9Q9CZN4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Shisa9Q9CZN4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Shisa9Q9CZN4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Shisa9Q9CZN4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Shisa9Q9CZN4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Shisa9Q9CZN4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Shisa9Q9CZN4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Shisa9Q9CZN4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Shisa9Q9CZN4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Shisa9Q9CZN4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Shisa9Q9CZN4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Shisa9Q9CZN4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Shisa9Q9CZN4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Shisa9Q9CZN4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Shisa9Q9CZN4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Shisa9Q9CZN4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Shisa9Q9CZN4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Shisa9Q9CZN4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Shisa9Q9CZN4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Shisa9Q9CZN4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Shisa9Q9CZN4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Shisa9Q9CZN4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Shisa9Q9CZN4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Shisa9Q9CZN4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Shisa9Q9CZN4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Shisa9Q9CZN4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Shisa9Q9CZN4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Shisa9Q9CZN4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Shisa9Q9CZN4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Shisa9Q9CZN4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Shisa9Q9CZN4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Shisa9Q9CZN4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Shisa9Q9CZN4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Shisa9Q9CZN4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Shisa9Q9CZN4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Shisa9Q9CZN4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Shisa9Q9CZN4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Shisa9Q9CZN4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Shisa9Q9CZN4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Shisa9Q9CZN4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Shisa9Q9CZN4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Shisa9Q9CZN4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Shisa9Q9CZN4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Shisa9Q9CZN4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Shisa9Q9CZN4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Shisa9Q9CZN4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Shisa9Q9CZN4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Shisa9Q9CZN4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Shisa9Q9CZN4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Shisa9Q9CZN4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Shisa9Q9CZN4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Shisa9Q9CZN4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Shisa9Q9CZN4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Shisa9Q9CZN4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Shisa9Q9CZN4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Shisa9Q9CZN4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Shisa9Q9CZN4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Shisa9Q9CZN4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Shisa9Q9CZN4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Shisa9Q9CZN4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Shisa9Q9CZN4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Shisa9Q9CZN4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Shisa9Q9CZN4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Shisa9Q9CZN4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Shisa9Q9CZN4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Shisa9Q9CZN4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Shisa9Q9CZN4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Shisa9Q9CZN4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Shisa9Q9CZN4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Shisa9Q9CZN4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Shisa9Q9CZN4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Shisa9Q9CZN4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Shisa9Q9CZN4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Shisa9Q9CZN4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Shisa9Q9CZN4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Shisa9Q9CZN4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Shisa9Q9CZN4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Shisa9Q9CZN4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Shisa9Q9CZN4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Shisa9Q9CZN4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Shisa9Q9CZN4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Shisa9Q9CZN4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Shisa9Q9CZN4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms