Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ6

Mis18a, Protein Mis18-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis18aQ9CZJ6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Mis18aQ9CZJ6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Mis18aQ9CZJ6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Mis18aQ9CZJ6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Mis18aQ9CZJ6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Mis18aQ9CZJ6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Mis18aQ9CZJ6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Mis18aQ9CZJ6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Mis18aQ9CZJ6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Mis18aQ9CZJ6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Mis18aQ9CZJ6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Mis18aQ9CZJ6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Mis18aQ9CZJ6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Mis18aQ9CZJ6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Mis18aQ9CZJ6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Mis18aQ9CZJ6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Mis18aQ9CZJ6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Mis18aQ9CZJ6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Mis18aQ9CZJ6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Mis18aQ9CZJ6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Mis18aQ9CZJ6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Mis18aQ9CZJ6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Mis18aQ9CZJ6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Mis18aQ9CZJ6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Mis18aQ9CZJ6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Mis18aQ9CZJ6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Mis18aQ9CZJ6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Mis18aQ9CZJ6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Mis18aQ9CZJ6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Mis18aQ9CZJ6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Mis18aQ9CZJ6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Mis18aQ9CZJ6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Mis18aQ9CZJ6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Mis18aQ9CZJ6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Mis18aQ9CZJ6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Mis18aQ9CZJ6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Mis18aQ9CZJ6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Mis18aQ9CZJ6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Mis18aQ9CZJ6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Mis18aQ9CZJ6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Mis18aQ9CZJ6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Mis18aQ9CZJ6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Mis18aQ9CZJ6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Mis18aQ9CZJ6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Mis18aQ9CZJ6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Mis18aQ9CZJ6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Mis18aQ9CZJ6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Mis18aQ9CZJ6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Mis18aQ9CZJ6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Mis18aQ9CZJ6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Mis18aQ9CZJ6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Mis18aQ9CZJ6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Mis18aQ9CZJ6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Mis18aQ9CZJ6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Mis18aQ9CZJ6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Mis18aQ9CZJ6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Mis18aQ9CZJ6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Mis18aQ9CZJ6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Mis18aQ9CZJ6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Mis18aQ9CZJ6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Mis18aQ9CZJ6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Mis18aQ9CZJ6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Mis18aQ9CZJ6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Mis18aQ9CZJ6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Mis18aQ9CZJ6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Mis18aQ9CZJ6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Mis18aQ9CZJ6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Mis18aQ9CZJ6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Mis18aQ9CZJ6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Mis18aQ9CZJ6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Mis18aQ9CZJ6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Mis18aQ9CZJ6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Mis18aQ9CZJ6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Mis18aQ9CZJ6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Mis18aQ9CZJ6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Mis18aQ9CZJ6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Mis18aQ9CZJ6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Mis18aQ9CZJ6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Mis18aQ9CZJ6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Mis18aQ9CZJ6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Mis18aQ9CZJ6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Mis18aQ9CZJ6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Mis18aQ9CZJ6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Mis18aQ9CZJ6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mis18aQ9CZJ6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mis18aQ9CZJ6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Mis18aQ9CZJ6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Mis18aQ9CZJ6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Mis18aQ9CZJ6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Mis18aQ9CZJ6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Mis18aQ9CZJ6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Mis18aQ9CZJ6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Mis18aQ9CZJ6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Mis18aQ9CZJ6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Mis18aQ9CZJ6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Mis18aQ9CZJ6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Mis18aQ9CZJ6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Mis18aQ9CZJ6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Mis18aQ9CZJ6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Mis18aQ9CZJ6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms