Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW6

3100002H09Rik, RIKEN cDNA 3100002H09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3100002H09RikQ9CXW6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
3100002H09RikQ9CXW6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
3100002H09RikQ9CXW6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
3100002H09RikQ9CXW6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
3100002H09RikQ9CXW6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
3100002H09RikQ9CXW6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
3100002H09RikQ9CXW6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
3100002H09RikQ9CXW6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
3100002H09RikQ9CXW6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
3100002H09RikQ9CXW6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
3100002H09RikQ9CXW6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
3100002H09RikQ9CXW6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
3100002H09RikQ9CXW6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
3100002H09RikQ9CXW6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
3100002H09RikQ9CXW6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
3100002H09RikQ9CXW6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
3100002H09RikQ9CXW6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
3100002H09RikQ9CXW6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
3100002H09RikQ9CXW6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
3100002H09RikQ9CXW6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
3100002H09RikQ9CXW6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
3100002H09RikQ9CXW6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
3100002H09RikQ9CXW6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
3100002H09RikQ9CXW6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
3100002H09RikQ9CXW6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
3100002H09RikQ9CXW6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
3100002H09RikQ9CXW6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
3100002H09RikQ9CXW6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
3100002H09RikQ9CXW6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
3100002H09RikQ9CXW6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
3100002H09RikQ9CXW6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
3100002H09RikQ9CXW6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
3100002H09RikQ9CXW6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
3100002H09RikQ9CXW6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
3100002H09RikQ9CXW6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
3100002H09RikQ9CXW6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
3100002H09RikQ9CXW6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
3100002H09RikQ9CXW6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
3100002H09RikQ9CXW6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
3100002H09RikQ9CXW6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
3100002H09RikQ9CXW6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
3100002H09RikQ9CXW6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
3100002H09RikQ9CXW6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
3100002H09RikQ9CXW6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
3100002H09RikQ9CXW6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
3100002H09RikQ9CXW6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
3100002H09RikQ9CXW6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.87
3100002H09RikQ9CXW6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
3100002H09RikQ9CXW6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
3100002H09RikQ9CXW6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
3100002H09RikQ9CXW6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
3100002H09RikQ9CXW6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
3100002H09RikQ9CXW6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
3100002H09RikQ9CXW6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
3100002H09RikQ9CXW6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
3100002H09RikQ9CXW6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
3100002H09RikQ9CXW6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
3100002H09RikQ9CXW6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
3100002H09RikQ9CXW6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
3100002H09RikQ9CXW6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
3100002H09RikQ9CXW6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
3100002H09RikQ9CXW6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
3100002H09RikQ9CXW6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
3100002H09RikQ9CXW6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
3100002H09RikQ9CXW6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
3100002H09RikQ9CXW6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
3100002H09RikQ9CXW6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
3100002H09RikQ9CXW6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
3100002H09RikQ9CXW6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
3100002H09RikQ9CXW6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
3100002H09RikQ9CXW6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
3100002H09RikQ9CXW6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
3100002H09RikQ9CXW6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
3100002H09RikQ9CXW6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
3100002H09RikQ9CXW6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
3100002H09RikQ9CXW6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
3100002H09RikQ9CXW6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
3100002H09RikQ9CXW6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
3100002H09RikQ9CXW6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
3100002H09RikQ9CXW6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
3100002H09RikQ9CXW6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
3100002H09RikQ9CXW6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
3100002H09RikQ9CXW6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
3100002H09RikQ9CXW6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
3100002H09RikQ9CXW6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
3100002H09RikQ9CXW6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
3100002H09RikQ9CXW6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
3100002H09RikQ9CXW6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
3100002H09RikQ9CXW6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
3100002H09RikQ9CXW6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
3100002H09RikQ9CXW6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
3100002H09RikQ9CXW6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
3100002H09RikQ9CXW6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
3100002H09RikQ9CXW6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
3100002H09RikQ9CXW6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
3100002H09RikQ9CXW6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
3100002H09RikQ9CXW6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
3100002H09RikQ9CXW6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
3100002H09RikQ9CXW6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
3100002H09RikQ9CXW6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms