Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVR1

Gm26657, Predicted gene, 26657 (Fragment), mousemouse

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Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm26657Q9CVR1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm26657Q9CVR1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm26657Q9CVR1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm26657Q9CVR1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm26657Q9CVR1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm26657Q9CVR1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm26657Q9CVR1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm26657Q9CVR1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm26657Q9CVR1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm26657Q9CVR1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm26657Q9CVR1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm26657Q9CVR1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm26657Q9CVR1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm26657Q9CVR1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm26657Q9CVR1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm26657Q9CVR1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm26657Q9CVR1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm26657Q9CVR1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm26657Q9CVR1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm26657Q9CVR1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm26657Q9CVR1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm26657Q9CVR1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm26657Q9CVR1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm26657Q9CVR1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm26657Q9CVR1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm26657Q9CVR1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm26657Q9CVR1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm26657Q9CVR1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm26657Q9CVR1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm26657Q9CVR1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm26657Q9CVR1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm26657Q9CVR1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm26657Q9CVR1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm26657Q9CVR1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm26657Q9CVR1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm26657Q9CVR1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm26657Q9CVR1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm26657Q9CVR1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm26657Q9CVR1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm26657Q9CVR1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm26657Q9CVR1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm26657Q9CVR1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm26657Q9CVR1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm26657Q9CVR1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm26657Q9CVR1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm26657Q9CVR1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm26657Q9CVR1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm26657Q9CVR1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm26657Q9CVR1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm26657Q9CVR1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm26657Q9CVR1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm26657Q9CVR1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm26657Q9CVR1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm26657Q9CVR1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm26657Q9CVR1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm26657Q9CVR1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm26657Q9CVR1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm26657Q9CVR1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm26657Q9CVR1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm26657Q9CVR1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm26657Q9CVR1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm26657Q9CVR1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm26657Q9CVR1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm26657Q9CVR1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm26657Q9CVR1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm26657Q9CVR1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm26657Q9CVR1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm26657Q9CVR1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm26657Q9CVR1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm26657Q9CVR1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm26657Q9CVR1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm26657Q9CVR1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm26657Q9CVR1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm26657Q9CVR1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm26657Q9CVR1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm26657Q9CVR1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm26657Q9CVR1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm26657Q9CVR1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm26657Q9CVR1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm26657Q9CVR1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm26657Q9CVR1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm26657Q9CVR1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm26657Q9CVR1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm26657Q9CVR1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm26657Q9CVR1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm26657Q9CVR1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm26657Q9CVR1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm26657Q9CVR1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm26657Q9CVR1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm26657Q9CVR1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm26657Q9CVR1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm26657Q9CVR1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm26657Q9CVR1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm26657Q9CVR1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm26657Q9CVR1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm26657Q9CVR1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm26657Q9CVR1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm26657Q9CVR1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm26657Q9CVR1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm26657Q9CVR1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1239.1 ms