Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Atxn3Q9CVD2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Atxn3Q9CVD2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Atxn3Q9CVD2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Atxn3Q9CVD2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Atxn3Q9CVD2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Atxn3Q9CVD2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Atxn3Q9CVD2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Atxn3Q9CVD2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Atxn3Q9CVD2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Atxn3Q9CVD2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Atxn3Q9CVD2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Atxn3Q9CVD2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Atxn3Q9CVD2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Atxn3Q9CVD2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Atxn3Q9CVD2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Atxn3Q9CVD2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Atxn3Q9CVD2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Atxn3Q9CVD2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Atxn3Q9CVD2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Atxn3Q9CVD2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Atxn3Q9CVD2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Atxn3Q9CVD2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Atxn3Q9CVD2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Atxn3Q9CVD2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Atxn3Q9CVD2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
Atxn3Q9CVD2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Atxn3Q9CVD2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Atxn3Q9CVD2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Atxn3Q9CVD2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Atxn3Q9CVD2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Atxn3Q9CVD2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Atxn3Q9CVD2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Atxn3Q9CVD2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Atxn3Q9CVD2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Atxn3Q9CVD2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Atxn3Q9CVD2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Atxn3Q9CVD2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
Atxn3Q9CVD2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
Atxn3Q9CVD2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Atxn3Q9CVD2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Atxn3Q9CVD2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Atxn3Q9CVD2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Atxn3Q9CVD2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Atxn3Q9CVD2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Atxn3Q9CVD2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Atxn3Q9CVD2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Atxn3Q9CVD2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Atxn3Q9CVD2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Atxn3Q9CVD2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Atxn3Q9CVD2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Atxn3Q9CVD2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Atxn3Q9CVD2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Atxn3Q9CVD2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Atxn3Q9CVD2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Atxn3Q9CVD2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Atxn3Q9CVD2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Atxn3Q9CVD2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Atxn3Q9CVD2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Atxn3Q9CVD2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Atxn3Q9CVD2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Atxn3Q9CVD2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Atxn3Q9CVD2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Atxn3Q9CVD2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Atxn3Q9CVD2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Atxn3Q9CVD2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Atxn3Q9CVD2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Atxn3Q9CVD2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Atxn3Q9CVD2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Atxn3Q9CVD2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Atxn3Q9CVD2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Atxn3Q9CVD2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Atxn3Q9CVD2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Atxn3Q9CVD2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Atxn3Q9CVD2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Atxn3Q9CVD2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Atxn3Q9CVD2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Atxn3Q9CVD2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Atxn3Q9CVD2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Atxn3Q9CVD2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Atxn3Q9CVD2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Atxn3Q9CVD2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Atxn3Q9CVD2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Atxn3Q9CVD2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Atxn3Q9CVD2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Atxn3Q9CVD2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Atxn3Q9CVD2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Atxn3Q9CVD2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Atxn3Q9CVD2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Atxn3Q9CVD2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Atxn3Q9CVD2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Atxn3Q9CVD2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Atxn3Q9CVD2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Atxn3Q9CVD2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Atxn3Q9CVD2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Atxn3Q9CVD2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Atxn3Q9CVD2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Atxn3Q9CVD2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Atxn3Q9CVD2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Atxn3Q9CVD2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms