Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRY7

Gdpd1, Lysophospholipase D GDPD1, mousemouse

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Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd1Q9CRY7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gdpd1Q9CRY7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gdpd1Q9CRY7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gdpd1Q9CRY7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gdpd1Q9CRY7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gdpd1Q9CRY7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gdpd1Q9CRY7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gdpd1Q9CRY7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gdpd1Q9CRY7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gdpd1Q9CRY7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gdpd1Q9CRY7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gdpd1Q9CRY7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gdpd1Q9CRY7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gdpd1Q9CRY7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gdpd1Q9CRY7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gdpd1Q9CRY7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gdpd1Q9CRY7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gdpd1Q9CRY7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gdpd1Q9CRY7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gdpd1Q9CRY7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gdpd1Q9CRY7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gdpd1Q9CRY7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gdpd1Q9CRY7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gdpd1Q9CRY7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Gdpd1Q9CRY7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gdpd1Q9CRY7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gdpd1Q9CRY7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gdpd1Q9CRY7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gdpd1Q9CRY7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gdpd1Q9CRY7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gdpd1Q9CRY7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gdpd1Q9CRY7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gdpd1Q9CRY7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gdpd1Q9CRY7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gdpd1Q9CRY7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gdpd1Q9CRY7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gdpd1Q9CRY7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gdpd1Q9CRY7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gdpd1Q9CRY7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gdpd1Q9CRY7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gdpd1Q9CRY7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gdpd1Q9CRY7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gdpd1Q9CRY7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gdpd1Q9CRY7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gdpd1Q9CRY7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gdpd1Q9CRY7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gdpd1Q9CRY7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gdpd1Q9CRY7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gdpd1Q9CRY7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gdpd1Q9CRY7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gdpd1Q9CRY7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gdpd1Q9CRY7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gdpd1Q9CRY7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gdpd1Q9CRY7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gdpd1Q9CRY7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gdpd1Q9CRY7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gdpd1Q9CRY7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gdpd1Q9CRY7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gdpd1Q9CRY7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gdpd1Q9CRY7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gdpd1Q9CRY7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gdpd1Q9CRY7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gdpd1Q9CRY7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gdpd1Q9CRY7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gdpd1Q9CRY7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gdpd1Q9CRY7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gdpd1Q9CRY7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gdpd1Q9CRY7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gdpd1Q9CRY7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gdpd1Q9CRY7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gdpd1Q9CRY7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gdpd1Q9CRY7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gdpd1Q9CRY7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Gdpd1Q9CRY7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gdpd1Q9CRY7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gdpd1Q9CRY7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gdpd1Q9CRY7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gdpd1Q9CRY7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gdpd1Q9CRY7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gdpd1Q9CRY7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gdpd1Q9CRY7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gdpd1Q9CRY7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gdpd1Q9CRY7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gdpd1Q9CRY7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gdpd1Q9CRY7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gdpd1Q9CRY7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gdpd1Q9CRY7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Gdpd1Q9CRY7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gdpd1Q9CRY7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gdpd1Q9CRY7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gdpd1Q9CRY7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gdpd1Q9CRY7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gdpd1Q9CRY7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gdpd1Q9CRY7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gdpd1Q9CRY7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gdpd1Q9CRY7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gdpd1Q9CRY7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gdpd1Q9CRY7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Gdpd1Q9CRY7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gdpd1Q9CRY7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms