Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR29

Ccdc43, Coiled-coil domain-containing protein 43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc43Q9CR29 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ccdc43Q9CR29 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc43Q9CR29 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc43Q9CR29 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc43Q9CR29 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc43Q9CR29 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc43Q9CR29 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc43Q9CR29 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc43Q9CR29 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc43Q9CR29 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc43Q9CR29 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc43Q9CR29 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc43Q9CR29 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc43Q9CR29 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc43Q9CR29 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc43Q9CR29 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc43Q9CR29 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc43Q9CR29 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc43Q9CR29 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc43Q9CR29 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc43Q9CR29 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc43Q9CR29 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc43Q9CR29 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc43Q9CR29 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc43Q9CR29 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc43Q9CR29 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc43Q9CR29 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc43Q9CR29 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc43Q9CR29 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc43Q9CR29 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc43Q9CR29 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc43Q9CR29 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc43Q9CR29 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc43Q9CR29 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc43Q9CR29 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc43Q9CR29 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc43Q9CR29 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc43Q9CR29 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc43Q9CR29 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc43Q9CR29 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc43Q9CR29 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc43Q9CR29 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc43Q9CR29 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc43Q9CR29 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc43Q9CR29 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc43Q9CR29 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc43Q9CR29 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc43Q9CR29 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc43Q9CR29 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc43Q9CR29 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc43Q9CR29 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc43Q9CR29 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc43Q9CR29 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc43Q9CR29 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc43Q9CR29 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc43Q9CR29 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc43Q9CR29 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc43Q9CR29 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc43Q9CR29 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc43Q9CR29 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc43Q9CR29 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc43Q9CR29 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc43Q9CR29 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc43Q9CR29 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc43Q9CR29 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc43Q9CR29 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc43Q9CR29 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc43Q9CR29 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc43Q9CR29 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc43Q9CR29 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc43Q9CR29 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc43Q9CR29 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc43Q9CR29 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc43Q9CR29 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc43Q9CR29 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc43Q9CR29 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc43Q9CR29 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc43Q9CR29 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc43Q9CR29 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc43Q9CR29 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc43Q9CR29 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc43Q9CR29 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc43Q9CR29 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc43Q9CR29 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc43Q9CR29 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc43Q9CR29 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc43Q9CR29 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc43Q9CR29 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc43Q9CR29 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc43Q9CR29 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc43Q9CR29 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc43Q9CR29 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc43Q9CR29 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc43Q9CR29 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc43Q9CR29 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc43Q9CR29 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ccdc43Q9CR29 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc43Q9CR29 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc43Q9CR29 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc43Q9CR29 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms