Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQX6

Gm16286, MCG141091, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm16286Q9CQX6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm16286Q9CQX6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm16286Q9CQX6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm16286Q9CQX6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm16286Q9CQX6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm16286Q9CQX6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm16286Q9CQX6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm16286Q9CQX6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm16286Q9CQX6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm16286Q9CQX6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm16286Q9CQX6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm16286Q9CQX6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm16286Q9CQX6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm16286Q9CQX6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm16286Q9CQX6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm16286Q9CQX6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm16286Q9CQX6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm16286Q9CQX6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm16286Q9CQX6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm16286Q9CQX6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm16286Q9CQX6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm16286Q9CQX6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm16286Q9CQX6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm16286Q9CQX6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm16286Q9CQX6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm16286Q9CQX6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm16286Q9CQX6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm16286Q9CQX6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm16286Q9CQX6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm16286Q9CQX6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm16286Q9CQX6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm16286Q9CQX6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm16286Q9CQX6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm16286Q9CQX6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm16286Q9CQX6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm16286Q9CQX6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm16286Q9CQX6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm16286Q9CQX6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm16286Q9CQX6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm16286Q9CQX6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm16286Q9CQX6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm16286Q9CQX6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm16286Q9CQX6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm16286Q9CQX6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm16286Q9CQX6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm16286Q9CQX6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm16286Q9CQX6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm16286Q9CQX6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm16286Q9CQX6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm16286Q9CQX6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm16286Q9CQX6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm16286Q9CQX6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm16286Q9CQX6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm16286Q9CQX6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm16286Q9CQX6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm16286Q9CQX6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm16286Q9CQX6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm16286Q9CQX6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm16286Q9CQX6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm16286Q9CQX6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm16286Q9CQX6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm16286Q9CQX6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm16286Q9CQX6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm16286Q9CQX6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm16286Q9CQX6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm16286Q9CQX6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm16286Q9CQX6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm16286Q9CQX6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm16286Q9CQX6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm16286Q9CQX6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm16286Q9CQX6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm16286Q9CQX6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Gm16286Q9CQX6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm16286Q9CQX6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm16286Q9CQX6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm16286Q9CQX6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm16286Q9CQX6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm16286Q9CQX6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm16286Q9CQX6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm16286Q9CQX6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm16286Q9CQX6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm16286Q9CQX6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm16286Q9CQX6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm16286Q9CQX6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm16286Q9CQX6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm16286Q9CQX6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm16286Q9CQX6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm16286Q9CQX6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm16286Q9CQX6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm16286Q9CQX6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm16286Q9CQX6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm16286Q9CQX6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm16286Q9CQX6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm16286Q9CQX6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm16286Q9CQX6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm16286Q9CQX6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm16286Q9CQX6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gm16286Q9CQX6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm16286Q9CQX6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm16286Q9CQX6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms