Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nicn1Q9CQM0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nicn1Q9CQM0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nicn1Q9CQM0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nicn1Q9CQM0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nicn1Q9CQM0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nicn1Q9CQM0 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nicn1Q9CQM0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nicn1Q9CQM0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nicn1Q9CQM0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nicn1Q9CQM0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nicn1Q9CQM0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nicn1Q9CQM0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nicn1Q9CQM0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Nicn1Q9CQM0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Nicn1Q9CQM0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nicn1Q9CQM0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nicn1Q9CQM0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nicn1Q9CQM0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Nicn1Q9CQM0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nicn1Q9CQM0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nicn1Q9CQM0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nicn1Q9CQM0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nicn1Q9CQM0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nicn1Q9CQM0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nicn1Q9CQM0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nicn1Q9CQM0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nicn1Q9CQM0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nicn1Q9CQM0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nicn1Q9CQM0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nicn1Q9CQM0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nicn1Q9CQM0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nicn1Q9CQM0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nicn1Q9CQM0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nicn1Q9CQM0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nicn1Q9CQM0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nicn1Q9CQM0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nicn1Q9CQM0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nicn1Q9CQM0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nicn1Q9CQM0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Nicn1Q9CQM0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Nicn1Q9CQM0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nicn1Q9CQM0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nicn1Q9CQM0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nicn1Q9CQM0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nicn1Q9CQM0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nicn1Q9CQM0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nicn1Q9CQM0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nicn1Q9CQM0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nicn1Q9CQM0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nicn1Q9CQM0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nicn1Q9CQM0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nicn1Q9CQM0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nicn1Q9CQM0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nicn1Q9CQM0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nicn1Q9CQM0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Nicn1Q9CQM0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nicn1Q9CQM0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nicn1Q9CQM0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nicn1Q9CQM0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nicn1Q9CQM0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Nicn1Q9CQM0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nicn1Q9CQM0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nicn1Q9CQM0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nicn1Q9CQM0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nicn1Q9CQM0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nicn1Q9CQM0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nicn1Q9CQM0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nicn1Q9CQM0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nicn1Q9CQM0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nicn1Q9CQM0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nicn1Q9CQM0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nicn1Q9CQM0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nicn1Q9CQM0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Nicn1Q9CQM0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nicn1Q9CQM0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nicn1Q9CQM0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nicn1Q9CQM0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nicn1Q9CQM0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nicn1Q9CQM0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nicn1Q9CQM0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nicn1Q9CQM0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nicn1Q9CQM0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nicn1Q9CQM0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nicn1Q9CQM0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nicn1Q9CQM0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nicn1Q9CQM0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nicn1Q9CQM0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nicn1Q9CQM0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nicn1Q9CQM0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nicn1Q9CQM0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nicn1Q9CQM0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nicn1Q9CQM0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nicn1Q9CQM0 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nicn1Q9CQM0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nicn1Q9CQM0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nicn1Q9CQM0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nicn1Q9CQM0 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nicn1Q9CQM0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nicn1Q9CQM0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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