Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE7

Ergic3, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ergic3Q9CQE7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ergic3Q9CQE7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ergic3Q9CQE7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ergic3Q9CQE7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ergic3Q9CQE7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ergic3Q9CQE7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Ergic3Q9CQE7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ergic3Q9CQE7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ergic3Q9CQE7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ergic3Q9CQE7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ergic3Q9CQE7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ergic3Q9CQE7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ergic3Q9CQE7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ergic3Q9CQE7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ergic3Q9CQE7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ergic3Q9CQE7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ergic3Q9CQE7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ergic3Q9CQE7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ergic3Q9CQE7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ergic3Q9CQE7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ergic3Q9CQE7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ergic3Q9CQE7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ergic3Q9CQE7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ergic3Q9CQE7 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ergic3Q9CQE7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ergic3Q9CQE7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ergic3Q9CQE7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ergic3Q9CQE7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ergic3Q9CQE7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ergic3Q9CQE7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ergic3Q9CQE7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ergic3Q9CQE7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ergic3Q9CQE7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ergic3Q9CQE7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ergic3Q9CQE7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ergic3Q9CQE7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ergic3Q9CQE7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ergic3Q9CQE7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ergic3Q9CQE7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ergic3Q9CQE7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ergic3Q9CQE7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ergic3Q9CQE7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ergic3Q9CQE7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ergic3Q9CQE7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ergic3Q9CQE7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ergic3Q9CQE7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ergic3Q9CQE7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ergic3Q9CQE7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ergic3Q9CQE7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ergic3Q9CQE7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ergic3Q9CQE7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ergic3Q9CQE7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ergic3Q9CQE7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ergic3Q9CQE7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ergic3Q9CQE7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ergic3Q9CQE7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ergic3Q9CQE7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ergic3Q9CQE7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ergic3Q9CQE7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ergic3Q9CQE7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ergic3Q9CQE7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ergic3Q9CQE7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ergic3Q9CQE7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ergic3Q9CQE7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ergic3Q9CQE7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ergic3Q9CQE7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ergic3Q9CQE7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ergic3Q9CQE7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ergic3Q9CQE7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ergic3Q9CQE7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ergic3Q9CQE7 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Ergic3Q9CQE7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ergic3Q9CQE7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ergic3Q9CQE7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Ergic3Q9CQE7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ergic3Q9CQE7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ergic3Q9CQE7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ergic3Q9CQE7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ergic3Q9CQE7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Ergic3Q9CQE7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ergic3Q9CQE7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ergic3Q9CQE7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ergic3Q9CQE7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ergic3Q9CQE7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ergic3Q9CQE7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ergic3Q9CQE7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ergic3Q9CQE7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ergic3Q9CQE7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ergic3Q9CQE7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ergic3Q9CQE7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ergic3Q9CQE7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ergic3Q9CQE7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ergic3Q9CQE7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ergic3Q9CQE7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ergic3Q9CQE7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ergic3Q9CQE7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ergic3Q9CQE7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ergic3Q9CQE7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ergic3Q9CQE7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ergic3Q9CQE7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms