Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
1700029P11RikQ9CQ68 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
1700029P11RikQ9CQ68 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
1700029P11RikQ9CQ68 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
1700029P11RikQ9CQ68 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
1700029P11RikQ9CQ68 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
1700029P11RikQ9CQ68 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
1700029P11RikQ9CQ68 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
1700029P11RikQ9CQ68 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
1700029P11RikQ9CQ68 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
1700029P11RikQ9CQ68 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
1700029P11RikQ9CQ68 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
1700029P11RikQ9CQ68 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
1700029P11RikQ9CQ68 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
1700029P11RikQ9CQ68 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
1700029P11RikQ9CQ68 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
1700029P11RikQ9CQ68 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
1700029P11RikQ9CQ68 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
1700029P11RikQ9CQ68 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
1700029P11RikQ9CQ68 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
1700029P11RikQ9CQ68 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
1700029P11RikQ9CQ68 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
1700029P11RikQ9CQ68 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
1700029P11RikQ9CQ68 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
1700029P11RikQ9CQ68 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
1700029P11RikQ9CQ68 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
1700029P11RikQ9CQ68 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
1700029P11RikQ9CQ68 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
1700029P11RikQ9CQ68 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
1700029P11RikQ9CQ68 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
1700029P11RikQ9CQ68 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
1700029P11RikQ9CQ68 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
1700029P11RikQ9CQ68 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
1700029P11RikQ9CQ68 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
1700029P11RikQ9CQ68 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
1700029P11RikQ9CQ68 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
1700029P11RikQ9CQ68 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
1700029P11RikQ9CQ68 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
1700029P11RikQ9CQ68 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
1700029P11RikQ9CQ68 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
1700029P11RikQ9CQ68 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
1700029P11RikQ9CQ68 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
1700029P11RikQ9CQ68 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
1700029P11RikQ9CQ68 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
1700029P11RikQ9CQ68 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
1700029P11RikQ9CQ68 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
1700029P11RikQ9CQ68 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
1700029P11RikQ9CQ68 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
1700029P11RikQ9CQ68 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
1700029P11RikQ9CQ68 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
1700029P11RikQ9CQ68 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
1700029P11RikQ9CQ68 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
1700029P11RikQ9CQ68 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
1700029P11RikQ9CQ68 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
1700029P11RikQ9CQ68 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
1700029P11RikQ9CQ68 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
1700029P11RikQ9CQ68 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
1700029P11RikQ9CQ68 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
1700029P11RikQ9CQ68 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
1700029P11RikQ9CQ68 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
1700029P11RikQ9CQ68 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
1700029P11RikQ9CQ68 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
1700029P11RikQ9CQ68 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
1700029P11RikQ9CQ68 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
1700029P11RikQ9CQ68 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
1700029P11RikQ9CQ68 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
1700029P11RikQ9CQ68 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
1700029P11RikQ9CQ68 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
1700029P11RikQ9CQ68 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
1700029P11RikQ9CQ68 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
1700029P11RikQ9CQ68 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
1700029P11RikQ9CQ68 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
1700029P11RikQ9CQ68 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
1700029P11RikQ9CQ68 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
1700029P11RikQ9CQ68 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
1700029P11RikQ9CQ68 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
1700029P11RikQ9CQ68 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
1700029P11RikQ9CQ68 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
1700029P11RikQ9CQ68 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
1700029P11RikQ9CQ68 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
1700029P11RikQ9CQ68 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
1700029P11RikQ9CQ68 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
1700029P11RikQ9CQ68 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
1700029P11RikQ9CQ68 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
1700029P11RikQ9CQ68 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
1700029P11RikQ9CQ68 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
1700029P11RikQ9CQ68 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
1700029P11RikQ9CQ68 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
1700029P11RikQ9CQ68 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
1700029P11RikQ9CQ68 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
1700029P11RikQ9CQ68 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
1700029P11RikQ9CQ68 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
1700029P11RikQ9CQ68 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
1700029P11RikQ9CQ68 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
1700029P11RikQ9CQ68 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
1700029P11RikQ9CQ68 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
1700029P11RikQ9CQ68 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
1700029P11RikQ9CQ68 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms