Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ45

Nenf, Neudesin, mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NenfQ9CQ45 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NenfQ9CQ45 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NenfQ9CQ45 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NenfQ9CQ45 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NenfQ9CQ45 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NenfQ9CQ45 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NenfQ9CQ45 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NenfQ9CQ45 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NenfQ9CQ45 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NenfQ9CQ45 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NenfQ9CQ45 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NenfQ9CQ45 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NenfQ9CQ45 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NenfQ9CQ45 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NenfQ9CQ45 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NenfQ9CQ45 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NenfQ9CQ45 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NenfQ9CQ45 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NenfQ9CQ45 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NenfQ9CQ45 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NenfQ9CQ45 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NenfQ9CQ45 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NenfQ9CQ45 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NenfQ9CQ45 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NenfQ9CQ45 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NenfQ9CQ45 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NenfQ9CQ45 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
NenfQ9CQ45 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NenfQ9CQ45 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NenfQ9CQ45 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NenfQ9CQ45 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NenfQ9CQ45 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NenfQ9CQ45 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NenfQ9CQ45 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NenfQ9CQ45 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NenfQ9CQ45 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NenfQ9CQ45 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
NenfQ9CQ45 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NenfQ9CQ45 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NenfQ9CQ45 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NenfQ9CQ45 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NenfQ9CQ45 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NenfQ9CQ45 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NenfQ9CQ45 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NenfQ9CQ45 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NenfQ9CQ45 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NenfQ9CQ45 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NenfQ9CQ45 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NenfQ9CQ45 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NenfQ9CQ45 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NenfQ9CQ45 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NenfQ9CQ45 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NenfQ9CQ45 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
NenfQ9CQ45 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NenfQ9CQ45 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NenfQ9CQ45 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NenfQ9CQ45 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
NenfQ9CQ45 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NenfQ9CQ45 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NenfQ9CQ45 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NenfQ9CQ45 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NenfQ9CQ45 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NenfQ9CQ45 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NenfQ9CQ45 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NenfQ9CQ45 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NenfQ9CQ45 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NenfQ9CQ45 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NenfQ9CQ45 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NenfQ9CQ45 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NenfQ9CQ45 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NenfQ9CQ45 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NenfQ9CQ45 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NenfQ9CQ45 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NenfQ9CQ45 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NenfQ9CQ45 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NenfQ9CQ45 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NenfQ9CQ45 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NenfQ9CQ45 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NenfQ9CQ45 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NenfQ9CQ45 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NenfQ9CQ45 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NenfQ9CQ45 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NenfQ9CQ45 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NenfQ9CQ45 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NenfQ9CQ45 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NenfQ9CQ45 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NenfQ9CQ45 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NenfQ9CQ45 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
NenfQ9CQ45 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
NenfQ9CQ45 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NenfQ9CQ45 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NenfQ9CQ45 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NenfQ9CQ45 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NenfQ9CQ45 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NenfQ9CQ45 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NenfQ9CQ45 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NenfQ9CQ45 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NenfQ9CQ45 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NenfQ9CQ45 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NenfQ9CQ45 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 167.8 ms