Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR8

Nsmce3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce3Q9CPR8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nsmce3Q9CPR8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nsmce3Q9CPR8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nsmce3Q9CPR8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nsmce3Q9CPR8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nsmce3Q9CPR8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nsmce3Q9CPR8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Nsmce3Q9CPR8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nsmce3Q9CPR8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nsmce3Q9CPR8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nsmce3Q9CPR8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Nsmce3Q9CPR8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Nsmce3Q9CPR8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Nsmce3Q9CPR8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nsmce3Q9CPR8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nsmce3Q9CPR8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nsmce3Q9CPR8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nsmce3Q9CPR8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nsmce3Q9CPR8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nsmce3Q9CPR8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nsmce3Q9CPR8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nsmce3Q9CPR8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nsmce3Q9CPR8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Nsmce3Q9CPR8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nsmce3Q9CPR8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nsmce3Q9CPR8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nsmce3Q9CPR8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nsmce3Q9CPR8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nsmce3Q9CPR8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nsmce3Q9CPR8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nsmce3Q9CPR8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nsmce3Q9CPR8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nsmce3Q9CPR8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nsmce3Q9CPR8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nsmce3Q9CPR8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nsmce3Q9CPR8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nsmce3Q9CPR8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nsmce3Q9CPR8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nsmce3Q9CPR8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nsmce3Q9CPR8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Nsmce3Q9CPR8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nsmce3Q9CPR8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nsmce3Q9CPR8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nsmce3Q9CPR8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nsmce3Q9CPR8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nsmce3Q9CPR8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nsmce3Q9CPR8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nsmce3Q9CPR8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nsmce3Q9CPR8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nsmce3Q9CPR8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Nsmce3Q9CPR8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nsmce3Q9CPR8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nsmce3Q9CPR8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nsmce3Q9CPR8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nsmce3Q9CPR8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nsmce3Q9CPR8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nsmce3Q9CPR8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nsmce3Q9CPR8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nsmce3Q9CPR8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Nsmce3Q9CPR8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Nsmce3Q9CPR8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nsmce3Q9CPR8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nsmce3Q9CPR8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nsmce3Q9CPR8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Nsmce3Q9CPR8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nsmce3Q9CPR8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Nsmce3Q9CPR8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nsmce3Q9CPR8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nsmce3Q9CPR8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nsmce3Q9CPR8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nsmce3Q9CPR8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nsmce3Q9CPR8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nsmce3Q9CPR8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nsmce3Q9CPR8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nsmce3Q9CPR8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nsmce3Q9CPR8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nsmce3Q9CPR8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nsmce3Q9CPR8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nsmce3Q9CPR8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Nsmce3Q9CPR8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nsmce3Q9CPR8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nsmce3Q9CPR8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nsmce3Q9CPR8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nsmce3Q9CPR8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nsmce3Q9CPR8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nsmce3Q9CPR8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nsmce3Q9CPR8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nsmce3Q9CPR8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nsmce3Q9CPR8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nsmce3Q9CPR8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nsmce3Q9CPR8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nsmce3Q9CPR8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nsmce3Q9CPR8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nsmce3Q9CPR8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nsmce3Q9CPR8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nsmce3Q9CPR8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nsmce3Q9CPR8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nsmce3Q9CPR8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nsmce3Q9CPR8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nsmce3Q9CPR8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.5 ms