Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR4

Rpl17, 60S ribosomal protein L17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl17Q9CPR4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rpl17Q9CPR4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Rpl17Q9CPR4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rpl17Q9CPR4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rpl17Q9CPR4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rpl17Q9CPR4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rpl17Q9CPR4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rpl17Q9CPR4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rpl17Q9CPR4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rpl17Q9CPR4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Rpl17Q9CPR4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Rpl17Q9CPR4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rpl17Q9CPR4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rpl17Q9CPR4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rpl17Q9CPR4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rpl17Q9CPR4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rpl17Q9CPR4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rpl17Q9CPR4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rpl17Q9CPR4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rpl17Q9CPR4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rpl17Q9CPR4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rpl17Q9CPR4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rpl17Q9CPR4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rpl17Q9CPR4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rpl17Q9CPR4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rpl17Q9CPR4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rpl17Q9CPR4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rpl17Q9CPR4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rpl17Q9CPR4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rpl17Q9CPR4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rpl17Q9CPR4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rpl17Q9CPR4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rpl17Q9CPR4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rpl17Q9CPR4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rpl17Q9CPR4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rpl17Q9CPR4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rpl17Q9CPR4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rpl17Q9CPR4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rpl17Q9CPR4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rpl17Q9CPR4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rpl17Q9CPR4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rpl17Q9CPR4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rpl17Q9CPR4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Rpl17Q9CPR4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rpl17Q9CPR4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rpl17Q9CPR4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rpl17Q9CPR4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rpl17Q9CPR4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rpl17Q9CPR4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Rpl17Q9CPR4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Rpl17Q9CPR4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rpl17Q9CPR4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rpl17Q9CPR4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rpl17Q9CPR4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rpl17Q9CPR4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rpl17Q9CPR4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rpl17Q9CPR4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rpl17Q9CPR4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rpl17Q9CPR4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rpl17Q9CPR4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rpl17Q9CPR4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rpl17Q9CPR4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rpl17Q9CPR4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rpl17Q9CPR4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rpl17Q9CPR4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rpl17Q9CPR4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rpl17Q9CPR4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rpl17Q9CPR4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Rpl17Q9CPR4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rpl17Q9CPR4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rpl17Q9CPR4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rpl17Q9CPR4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rpl17Q9CPR4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rpl17Q9CPR4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rpl17Q9CPR4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rpl17Q9CPR4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rpl17Q9CPR4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rpl17Q9CPR4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rpl17Q9CPR4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rpl17Q9CPR4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rpl17Q9CPR4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rpl17Q9CPR4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rpl17Q9CPR4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rpl17Q9CPR4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rpl17Q9CPR4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rpl17Q9CPR4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rpl17Q9CPR4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rpl17Q9CPR4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rpl17Q9CPR4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rpl17Q9CPR4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rpl17Q9CPR4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rpl17Q9CPR4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rpl17Q9CPR4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Rpl17Q9CPR4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rpl17Q9CPR4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rpl17Q9CPR4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rpl17Q9CPR4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rpl17Q9CPR4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rpl17Q9CPR4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rpl17Q9CPR4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms