Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF1

Bco2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, mousemouse

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco2Q99NF1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Bco2Q99NF1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Bco2Q99NF1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Bco2Q99NF1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Bco2Q99NF1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Bco2Q99NF1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Bco2Q99NF1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Bco2Q99NF1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Bco2Q99NF1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Bco2Q99NF1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Bco2Q99NF1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Bco2Q99NF1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Bco2Q99NF1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Bco2Q99NF1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Bco2Q99NF1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Bco2Q99NF1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Bco2Q99NF1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Bco2Q99NF1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Bco2Q99NF1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Bco2Q99NF1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Bco2Q99NF1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Bco2Q99NF1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Bco2Q99NF1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Bco2Q99NF1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Bco2Q99NF1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Bco2Q99NF1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Bco2Q99NF1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Bco2Q99NF1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Bco2Q99NF1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Bco2Q99NF1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Bco2Q99NF1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Bco2Q99NF1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Bco2Q99NF1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Bco2Q99NF1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Bco2Q99NF1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Bco2Q99NF1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Bco2Q99NF1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Bco2Q99NF1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Bco2Q99NF1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Bco2Q99NF1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Bco2Q99NF1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Bco2Q99NF1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Bco2Q99NF1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Bco2Q99NF1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Bco2Q99NF1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Bco2Q99NF1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Bco2Q99NF1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Bco2Q99NF1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Bco2Q99NF1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Bco2Q99NF1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Bco2Q99NF1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Bco2Q99NF1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Bco2Q99NF1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Bco2Q99NF1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Bco2Q99NF1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Bco2Q99NF1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Bco2Q99NF1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Bco2Q99NF1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Bco2Q99NF1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Bco2Q99NF1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Bco2Q99NF1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Bco2Q99NF1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Bco2Q99NF1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Bco2Q99NF1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Bco2Q99NF1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Bco2Q99NF1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Bco2Q99NF1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Bco2Q99NF1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Bco2Q99NF1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Bco2Q99NF1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Bco2Q99NF1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Bco2Q99NF1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Bco2Q99NF1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Bco2Q99NF1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Bco2Q99NF1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Bco2Q99NF1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Bco2Q99NF1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Bco2Q99NF1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Bco2Q99NF1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Bco2Q99NF1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Bco2Q99NF1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Bco2Q99NF1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Bco2Q99NF1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Bco2Q99NF1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Bco2Q99NF1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Bco2Q99NF1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Bco2Q99NF1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Bco2Q99NF1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Bco2Q99NF1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Bco2Q99NF1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Bco2Q99NF1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Bco2Q99NF1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Bco2Q99NF1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Bco2Q99NF1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Bco2Q99NF1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Bco2Q99NF1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Bco2Q99NF1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Bco2Q99NF1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Bco2Q99NF1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Bco2Q99NF1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
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