Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI9

Clp1, Polyribonucleotide 5'-hydroxyl-kinase Clp1, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clp1Q99LI9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Clp1Q99LI9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Clp1Q99LI9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Clp1Q99LI9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Clp1Q99LI9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Clp1Q99LI9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Clp1Q99LI9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Clp1Q99LI9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Clp1Q99LI9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Clp1Q99LI9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Clp1Q99LI9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Clp1Q99LI9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Clp1Q99LI9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Clp1Q99LI9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Clp1Q99LI9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Clp1Q99LI9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Clp1Q99LI9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Clp1Q99LI9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Clp1Q99LI9 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Clp1Q99LI9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Clp1Q99LI9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Clp1Q99LI9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Clp1Q99LI9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Clp1Q99LI9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Clp1Q99LI9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Clp1Q99LI9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Clp1Q99LI9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Clp1Q99LI9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Clp1Q99LI9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Clp1Q99LI9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Clp1Q99LI9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Clp1Q99LI9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Clp1Q99LI9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Clp1Q99LI9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Clp1Q99LI9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Clp1Q99LI9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Clp1Q99LI9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Clp1Q99LI9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Clp1Q99LI9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Clp1Q99LI9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Clp1Q99LI9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Clp1Q99LI9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Clp1Q99LI9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Clp1Q99LI9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Clp1Q99LI9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Clp1Q99LI9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Clp1Q99LI9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Clp1Q99LI9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Clp1Q99LI9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Clp1Q99LI9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Clp1Q99LI9 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Clp1Q99LI9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Clp1Q99LI9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Clp1Q99LI9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Clp1Q99LI9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Clp1Q99LI9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Clp1Q99LI9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Clp1Q99LI9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Clp1Q99LI9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Clp1Q99LI9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Clp1Q99LI9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Clp1Q99LI9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Clp1Q99LI9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Clp1Q99LI9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Clp1Q99LI9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Clp1Q99LI9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Clp1Q99LI9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Clp1Q99LI9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Clp1Q99LI9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Clp1Q99LI9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Clp1Q99LI9 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Clp1Q99LI9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Clp1Q99LI9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Clp1Q99LI9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Clp1Q99LI9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Clp1Q99LI9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Clp1Q99LI9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Clp1Q99LI9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Clp1Q99LI9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Clp1Q99LI9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Clp1Q99LI9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Clp1Q99LI9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Clp1Q99LI9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Clp1Q99LI9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Clp1Q99LI9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Clp1Q99LI9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Clp1Q99LI9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Clp1Q99LI9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Clp1Q99LI9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Clp1Q99LI9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Clp1Q99LI9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Clp1Q99LI9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Clp1Q99LI9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Clp1Q99LI9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Clp1Q99LI9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Clp1Q99LI9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Clp1Q99LI9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Clp1Q99LI9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Clp1Q99LI9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Clp1Q99LI9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms