Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Sh3bp5lQ99LH9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Sh3bp5lQ99LH9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Sh3bp5lQ99LH9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Sh3bp5lQ99LH9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Sh3bp5lQ99LH9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Sh3bp5lQ99LH9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Sh3bp5lQ99LH9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Sh3bp5lQ99LH9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Sh3bp5lQ99LH9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Sh3bp5lQ99LH9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Sh3bp5lQ99LH9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Sh3bp5lQ99LH9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Sh3bp5lQ99LH9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Sh3bp5lQ99LH9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Sh3bp5lQ99LH9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Sh3bp5lQ99LH9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Sh3bp5lQ99LH9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Sh3bp5lQ99LH9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Sh3bp5lQ99LH9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Sh3bp5lQ99LH9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Sh3bp5lQ99LH9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Sh3bp5lQ99LH9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Sh3bp5lQ99LH9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Sh3bp5lQ99LH9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Sh3bp5lQ99LH9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Sh3bp5lQ99LH9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Sh3bp5lQ99LH9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Sh3bp5lQ99LH9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Sh3bp5lQ99LH9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Sh3bp5lQ99LH9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Sh3bp5lQ99LH9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Sh3bp5lQ99LH9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Sh3bp5lQ99LH9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Sh3bp5lQ99LH9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Sh3bp5lQ99LH9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Sh3bp5lQ99LH9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Sh3bp5lQ99LH9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Sh3bp5lQ99LH9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Sh3bp5lQ99LH9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Sh3bp5lQ99LH9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Sh3bp5lQ99LH9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Sh3bp5lQ99LH9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Sh3bp5lQ99LH9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Sh3bp5lQ99LH9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Sh3bp5lQ99LH9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Sh3bp5lQ99LH9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Sh3bp5lQ99LH9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Sh3bp5lQ99LH9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sh3bp5lQ99LH9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sh3bp5lQ99LH9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Sh3bp5lQ99LH9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Sh3bp5lQ99LH9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
Sh3bp5lQ99LH9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sh3bp5lQ99LH9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sh3bp5lQ99LH9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sh3bp5lQ99LH9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sh3bp5lQ99LH9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sh3bp5lQ99LH9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sh3bp5lQ99LH9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sh3bp5lQ99LH9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sh3bp5lQ99LH9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sh3bp5lQ99LH9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sh3bp5lQ99LH9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sh3bp5lQ99LH9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Sh3bp5lQ99LH9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Sh3bp5lQ99LH9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Sh3bp5lQ99LH9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sh3bp5lQ99LH9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sh3bp5lQ99LH9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Sh3bp5lQ99LH9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Sh3bp5lQ99LH9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Sh3bp5lQ99LH9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Sh3bp5lQ99LH9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Sh3bp5lQ99LH9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Sh3bp5lQ99LH9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Sh3bp5lQ99LH9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Sh3bp5lQ99LH9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Sh3bp5lQ99LH9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sh3bp5lQ99LH9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sh3bp5lQ99LH9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sh3bp5lQ99LH9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sh3bp5lQ99LH9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Sh3bp5lQ99LH9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sh3bp5lQ99LH9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Sh3bp5lQ99LH9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Sh3bp5lQ99LH9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Sh3bp5lQ99LH9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Sh3bp5lQ99LH9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Sh3bp5lQ99LH9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Sh3bp5lQ99LH9 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Sh3bp5lQ99LH9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Sh3bp5lQ99LH9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Sh3bp5lQ99LH9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Sh3bp5lQ99LH9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Sh3bp5lQ99LH9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Sh3bp5lQ99LH9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Sh3bp5lQ99LH9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms