Protein–RNA interactions for Protein: Q99KW3

Triobp, TRIO and F-actin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TriobpQ99KW3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TriobpQ99KW3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TriobpQ99KW3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TriobpQ99KW3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TriobpQ99KW3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TriobpQ99KW3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TriobpQ99KW3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TriobpQ99KW3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TriobpQ99KW3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TriobpQ99KW3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TriobpQ99KW3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TriobpQ99KW3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TriobpQ99KW3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TriobpQ99KW3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TriobpQ99KW3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TriobpQ99KW3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TriobpQ99KW3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TriobpQ99KW3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TriobpQ99KW3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TriobpQ99KW3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TriobpQ99KW3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TriobpQ99KW3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TriobpQ99KW3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TriobpQ99KW3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TriobpQ99KW3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TriobpQ99KW3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TriobpQ99KW3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TriobpQ99KW3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TriobpQ99KW3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TriobpQ99KW3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TriobpQ99KW3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TriobpQ99KW3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TriobpQ99KW3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TriobpQ99KW3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TriobpQ99KW3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TriobpQ99KW3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TriobpQ99KW3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TriobpQ99KW3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TriobpQ99KW3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TriobpQ99KW3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TriobpQ99KW3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TriobpQ99KW3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TriobpQ99KW3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TriobpQ99KW3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TriobpQ99KW3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TriobpQ99KW3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TriobpQ99KW3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TriobpQ99KW3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TriobpQ99KW3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TriobpQ99KW3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TriobpQ99KW3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TriobpQ99KW3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TriobpQ99KW3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TriobpQ99KW3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TriobpQ99KW3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TriobpQ99KW3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TriobpQ99KW3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TriobpQ99KW3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TriobpQ99KW3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TriobpQ99KW3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TriobpQ99KW3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TriobpQ99KW3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TriobpQ99KW3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TriobpQ99KW3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TriobpQ99KW3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TriobpQ99KW3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TriobpQ99KW3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TriobpQ99KW3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TriobpQ99KW3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TriobpQ99KW3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TriobpQ99KW3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TriobpQ99KW3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TriobpQ99KW3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TriobpQ99KW3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TriobpQ99KW3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TriobpQ99KW3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TriobpQ99KW3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TriobpQ99KW3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TriobpQ99KW3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TriobpQ99KW3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TriobpQ99KW3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TriobpQ99KW3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TriobpQ99KW3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TriobpQ99KW3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TriobpQ99KW3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TriobpQ99KW3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TriobpQ99KW3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TriobpQ99KW3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TriobpQ99KW3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TriobpQ99KW3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TriobpQ99KW3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TriobpQ99KW3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TriobpQ99KW3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TriobpQ99KW3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TriobpQ99KW3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TriobpQ99KW3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TriobpQ99KW3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TriobpQ99KW3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TriobpQ99KW3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TriobpQ99KW3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms