Protein–RNA interactions for Protein: Q99KC7

Smagp, Small cell adhesion glycoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmagpQ99KC7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SmagpQ99KC7 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SmagpQ99KC7 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SmagpQ99KC7 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SmagpQ99KC7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SmagpQ99KC7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SmagpQ99KC7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SmagpQ99KC7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SmagpQ99KC7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SmagpQ99KC7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SmagpQ99KC7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SmagpQ99KC7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SmagpQ99KC7 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SmagpQ99KC7 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SmagpQ99KC7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SmagpQ99KC7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SmagpQ99KC7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SmagpQ99KC7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SmagpQ99KC7 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SmagpQ99KC7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SmagpQ99KC7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SmagpQ99KC7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SmagpQ99KC7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SmagpQ99KC7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SmagpQ99KC7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SmagpQ99KC7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SmagpQ99KC7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SmagpQ99KC7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SmagpQ99KC7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SmagpQ99KC7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SmagpQ99KC7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SmagpQ99KC7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SmagpQ99KC7 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SmagpQ99KC7 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SmagpQ99KC7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SmagpQ99KC7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SmagpQ99KC7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SmagpQ99KC7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SmagpQ99KC7 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SmagpQ99KC7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SmagpQ99KC7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SmagpQ99KC7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SmagpQ99KC7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SmagpQ99KC7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SmagpQ99KC7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SmagpQ99KC7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SmagpQ99KC7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SmagpQ99KC7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SmagpQ99KC7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SmagpQ99KC7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SmagpQ99KC7 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SmagpQ99KC7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SmagpQ99KC7 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SmagpQ99KC7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SmagpQ99KC7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SmagpQ99KC7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SmagpQ99KC7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SmagpQ99KC7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SmagpQ99KC7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SmagpQ99KC7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SmagpQ99KC7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SmagpQ99KC7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SmagpQ99KC7 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SmagpQ99KC7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SmagpQ99KC7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SmagpQ99KC7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SmagpQ99KC7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SmagpQ99KC7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SmagpQ99KC7 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SmagpQ99KC7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SmagpQ99KC7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SmagpQ99KC7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SmagpQ99KC7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SmagpQ99KC7 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SmagpQ99KC7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SmagpQ99KC7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SmagpQ99KC7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SmagpQ99KC7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SmagpQ99KC7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SmagpQ99KC7 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SmagpQ99KC7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SmagpQ99KC7 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SmagpQ99KC7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SmagpQ99KC7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SmagpQ99KC7 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SmagpQ99KC7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SmagpQ99KC7 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SmagpQ99KC7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SmagpQ99KC7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SmagpQ99KC7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SmagpQ99KC7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SmagpQ99KC7 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SmagpQ99KC7 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SmagpQ99KC7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SmagpQ99KC7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SmagpQ99KC7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SmagpQ99KC7 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SmagpQ99KC7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SmagpQ99KC7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SmagpQ99KC7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.6 ms