Protein–RNA interactions for Protein: Q99K99

Uncharacterized protein C4orf19 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99K99 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Q99K99 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Q99K99 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Q99K99 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Q99K99 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Q99K99 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Q99K99 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Q99K99 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Q99K99 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Q99K99 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Q99K99 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Q99K99 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Q99K99 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Q99K99 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Q99K99 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Q99K99 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q99K99 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Q99K99 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q99K99 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q99K99 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Q99K99 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Q99K99 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Q99K99 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Q99K99 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Q99K99 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Q99K99 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Q99K99 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Q99K99 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q99K99 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q99K99 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q99K99 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q99K99 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q99K99 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q99K99 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q99K99 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q99K99 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q99K99 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q99K99 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q99K99 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q99K99 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q99K99 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q99K99 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q99K99 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q99K99 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q99K99 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q99K99 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q99K99 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q99K99 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q99K99 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q99K99 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Q99K99 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Q99K99 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Q99K99 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Q99K99 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Q99K99 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Q99K99 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Q99K99 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Q99K99 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Q99K99 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q99K99 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q99K99 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q99K99 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q99K99 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q99K99 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q99K99 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Q99K99 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Q99K99 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Q99K99 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Q99K99 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Q99K99 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Q99K99 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Q99K99 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Q99K99 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Q99K99 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Q99K99 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Q99K99 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Q99K99 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Q99K99 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Q99K99 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Q99K99 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Q99K99 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Q99K99 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Q99K99 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Q99K99 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Q99K99 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Q99K99 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Q99K99 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Q99K99 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Q99K99 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Q99K99 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Q99K99 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Q99K99 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Q99K99 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Q99K99 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Q99K99 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Q99K99 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Q99K99 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Q99K99 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Q99K99 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Q99K99 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms