Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW5

Epcam, Epithelial cell adhesion molecule, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EpcamQ99JW5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EpcamQ99JW5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EpcamQ99JW5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
EpcamQ99JW5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EpcamQ99JW5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EpcamQ99JW5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EpcamQ99JW5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EpcamQ99JW5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EpcamQ99JW5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EpcamQ99JW5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EpcamQ99JW5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EpcamQ99JW5 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EpcamQ99JW5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EpcamQ99JW5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EpcamQ99JW5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EpcamQ99JW5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EpcamQ99JW5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EpcamQ99JW5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EpcamQ99JW5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EpcamQ99JW5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EpcamQ99JW5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EpcamQ99JW5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
EpcamQ99JW5 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EpcamQ99JW5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EpcamQ99JW5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EpcamQ99JW5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EpcamQ99JW5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EpcamQ99JW5 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EpcamQ99JW5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EpcamQ99JW5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EpcamQ99JW5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EpcamQ99JW5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EpcamQ99JW5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EpcamQ99JW5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EpcamQ99JW5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EpcamQ99JW5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EpcamQ99JW5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EpcamQ99JW5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EpcamQ99JW5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EpcamQ99JW5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EpcamQ99JW5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EpcamQ99JW5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
EpcamQ99JW5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EpcamQ99JW5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EpcamQ99JW5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EpcamQ99JW5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EpcamQ99JW5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EpcamQ99JW5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EpcamQ99JW5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
EpcamQ99JW5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EpcamQ99JW5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EpcamQ99JW5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EpcamQ99JW5 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EpcamQ99JW5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EpcamQ99JW5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EpcamQ99JW5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EpcamQ99JW5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EpcamQ99JW5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EpcamQ99JW5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
EpcamQ99JW5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EpcamQ99JW5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EpcamQ99JW5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EpcamQ99JW5 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EpcamQ99JW5 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EpcamQ99JW5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EpcamQ99JW5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EpcamQ99JW5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EpcamQ99JW5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EpcamQ99JW5 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EpcamQ99JW5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EpcamQ99JW5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EpcamQ99JW5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EpcamQ99JW5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EpcamQ99JW5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EpcamQ99JW5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EpcamQ99JW5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EpcamQ99JW5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EpcamQ99JW5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EpcamQ99JW5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EpcamQ99JW5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EpcamQ99JW5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
EpcamQ99JW5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EpcamQ99JW5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EpcamQ99JW5 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EpcamQ99JW5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EpcamQ99JW5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EpcamQ99JW5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EpcamQ99JW5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EpcamQ99JW5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EpcamQ99JW5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EpcamQ99JW5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EpcamQ99JW5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EpcamQ99JW5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EpcamQ99JW5 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EpcamQ99JW5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EpcamQ99JW5 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EpcamQ99JW5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EpcamQ99JW5 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EpcamQ99JW5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EpcamQ99JW5 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms