Protein–RNA interactions for Protein: Q923K4

Gtpbp3, tRNA modification GTPase GTPBP3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp3Q923K4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtpbp3Q923K4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtpbp3Q923K4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtpbp3Q923K4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtpbp3Q923K4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gtpbp3Q923K4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gtpbp3Q923K4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gtpbp3Q923K4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gtpbp3Q923K4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtpbp3Q923K4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtpbp3Q923K4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtpbp3Q923K4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtpbp3Q923K4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtpbp3Q923K4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtpbp3Q923K4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtpbp3Q923K4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtpbp3Q923K4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtpbp3Q923K4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtpbp3Q923K4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtpbp3Q923K4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtpbp3Q923K4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtpbp3Q923K4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtpbp3Q923K4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtpbp3Q923K4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtpbp3Q923K4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtpbp3Q923K4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtpbp3Q923K4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtpbp3Q923K4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtpbp3Q923K4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtpbp3Q923K4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtpbp3Q923K4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtpbp3Q923K4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtpbp3Q923K4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtpbp3Q923K4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtpbp3Q923K4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtpbp3Q923K4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtpbp3Q923K4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gtpbp3Q923K4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gtpbp3Q923K4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gtpbp3Q923K4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gtpbp3Q923K4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtpbp3Q923K4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtpbp3Q923K4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtpbp3Q923K4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtpbp3Q923K4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtpbp3Q923K4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtpbp3Q923K4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtpbp3Q923K4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtpbp3Q923K4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtpbp3Q923K4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtpbp3Q923K4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtpbp3Q923K4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtpbp3Q923K4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gtpbp3Q923K4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Gtpbp3Q923K4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gtpbp3Q923K4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gtpbp3Q923K4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gtpbp3Q923K4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Gtpbp3Q923K4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gtpbp3Q923K4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gtpbp3Q923K4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gtpbp3Q923K4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gtpbp3Q923K4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gtpbp3Q923K4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gtpbp3Q923K4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gtpbp3Q923K4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gtpbp3Q923K4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gtpbp3Q923K4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gtpbp3Q923K4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtpbp3Q923K4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtpbp3Q923K4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtpbp3Q923K4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gtpbp3Q923K4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gtpbp3Q923K4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gtpbp3Q923K4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gtpbp3Q923K4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gtpbp3Q923K4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gtpbp3Q923K4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gtpbp3Q923K4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gtpbp3Q923K4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gtpbp3Q923K4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gtpbp3Q923K4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gtpbp3Q923K4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gtpbp3Q923K4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gtpbp3Q923K4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gtpbp3Q923K4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gtpbp3Q923K4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gtpbp3Q923K4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gtpbp3Q923K4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gtpbp3Q923K4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gtpbp3Q923K4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gtpbp3Q923K4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gtpbp3Q923K4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gtpbp3Q923K4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gtpbp3Q923K4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gtpbp3Q923K4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Gtpbp3Q923K4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gtpbp3Q923K4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gtpbp3Q923K4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gtpbp3Q923K4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms