Protein–RNA interactions for Protein: Q922L6

Nelfcd, Negative elongation factor D, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfcdQ922L6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NelfcdQ922L6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NelfcdQ922L6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NelfcdQ922L6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NelfcdQ922L6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NelfcdQ922L6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NelfcdQ922L6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NelfcdQ922L6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NelfcdQ922L6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NelfcdQ922L6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NelfcdQ922L6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NelfcdQ922L6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NelfcdQ922L6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NelfcdQ922L6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NelfcdQ922L6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NelfcdQ922L6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NelfcdQ922L6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NelfcdQ922L6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NelfcdQ922L6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NelfcdQ922L6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NelfcdQ922L6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NelfcdQ922L6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NelfcdQ922L6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NelfcdQ922L6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NelfcdQ922L6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NelfcdQ922L6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NelfcdQ922L6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NelfcdQ922L6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NelfcdQ922L6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NelfcdQ922L6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NelfcdQ922L6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NelfcdQ922L6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NelfcdQ922L6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NelfcdQ922L6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NelfcdQ922L6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NelfcdQ922L6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NelfcdQ922L6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NelfcdQ922L6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NelfcdQ922L6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NelfcdQ922L6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NelfcdQ922L6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NelfcdQ922L6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NelfcdQ922L6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NelfcdQ922L6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NelfcdQ922L6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NelfcdQ922L6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NelfcdQ922L6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NelfcdQ922L6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NelfcdQ922L6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NelfcdQ922L6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NelfcdQ922L6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NelfcdQ922L6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NelfcdQ922L6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NelfcdQ922L6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NelfcdQ922L6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NelfcdQ922L6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NelfcdQ922L6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NelfcdQ922L6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NelfcdQ922L6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NelfcdQ922L6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NelfcdQ922L6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NelfcdQ922L6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NelfcdQ922L6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NelfcdQ922L6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NelfcdQ922L6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NelfcdQ922L6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NelfcdQ922L6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NelfcdQ922L6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NelfcdQ922L6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NelfcdQ922L6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NelfcdQ922L6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NelfcdQ922L6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NelfcdQ922L6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NelfcdQ922L6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NelfcdQ922L6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NelfcdQ922L6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NelfcdQ922L6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NelfcdQ922L6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NelfcdQ922L6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NelfcdQ922L6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NelfcdQ922L6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NelfcdQ922L6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NelfcdQ922L6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NelfcdQ922L6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NelfcdQ922L6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NelfcdQ922L6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NelfcdQ922L6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NelfcdQ922L6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NelfcdQ922L6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NelfcdQ922L6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NelfcdQ922L6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NelfcdQ922L6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NelfcdQ922L6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NelfcdQ922L6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NelfcdQ922L6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NelfcdQ922L6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NelfcdQ922L6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NelfcdQ922L6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NelfcdQ922L6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NelfcdQ922L6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms