Protein–RNA interactions for Protein: Q920Q4

Vps16, Vacuolar protein sorting-associated protein 16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps16Q920Q4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Vps16Q920Q4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Vps16Q920Q4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Vps16Q920Q4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Vps16Q920Q4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Vps16Q920Q4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Vps16Q920Q4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Vps16Q920Q4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Vps16Q920Q4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Vps16Q920Q4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Vps16Q920Q4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Vps16Q920Q4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Vps16Q920Q4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Vps16Q920Q4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Vps16Q920Q4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Vps16Q920Q4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Vps16Q920Q4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Vps16Q920Q4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Vps16Q920Q4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Vps16Q920Q4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Vps16Q920Q4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Vps16Q920Q4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Vps16Q920Q4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Vps16Q920Q4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Vps16Q920Q4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Vps16Q920Q4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Vps16Q920Q4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Vps16Q920Q4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Vps16Q920Q4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Vps16Q920Q4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Vps16Q920Q4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Vps16Q920Q4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Vps16Q920Q4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Vps16Q920Q4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Vps16Q920Q4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Vps16Q920Q4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Vps16Q920Q4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Vps16Q920Q4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Vps16Q920Q4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Vps16Q920Q4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Vps16Q920Q4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Vps16Q920Q4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Vps16Q920Q4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Vps16Q920Q4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Vps16Q920Q4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Vps16Q920Q4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Vps16Q920Q4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Vps16Q920Q4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Vps16Q920Q4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Vps16Q920Q4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Vps16Q920Q4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Vps16Q920Q4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Vps16Q920Q4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Vps16Q920Q4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Vps16Q920Q4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Vps16Q920Q4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Vps16Q920Q4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Vps16Q920Q4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Vps16Q920Q4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Vps16Q920Q4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Vps16Q920Q4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Vps16Q920Q4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Vps16Q920Q4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Vps16Q920Q4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Vps16Q920Q4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Vps16Q920Q4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Vps16Q920Q4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Vps16Q920Q4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Vps16Q920Q4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Vps16Q920Q4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Vps16Q920Q4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Vps16Q920Q4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Vps16Q920Q4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Vps16Q920Q4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Vps16Q920Q4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Vps16Q920Q4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Vps16Q920Q4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Vps16Q920Q4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Vps16Q920Q4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Vps16Q920Q4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Vps16Q920Q4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
Vps16Q920Q4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Vps16Q920Q4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Vps16Q920Q4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Vps16Q920Q4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Vps16Q920Q4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Vps16Q920Q4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Vps16Q920Q4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Vps16Q920Q4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Vps16Q920Q4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Vps16Q920Q4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Vps16Q920Q4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Vps16Q920Q4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Vps16Q920Q4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Vps16Q920Q4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Vps16Q920Q4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Vps16Q920Q4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Vps16Q920Q4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Vps16Q920Q4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Vps16Q920Q4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms