Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZA3

Pcca, Propionyl-CoA carboxylase alpha chain, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PccaQ91ZA3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PccaQ91ZA3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PccaQ91ZA3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PccaQ91ZA3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PccaQ91ZA3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PccaQ91ZA3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PccaQ91ZA3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PccaQ91ZA3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PccaQ91ZA3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PccaQ91ZA3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PccaQ91ZA3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PccaQ91ZA3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PccaQ91ZA3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PccaQ91ZA3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PccaQ91ZA3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PccaQ91ZA3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PccaQ91ZA3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PccaQ91ZA3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PccaQ91ZA3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PccaQ91ZA3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PccaQ91ZA3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PccaQ91ZA3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PccaQ91ZA3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PccaQ91ZA3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PccaQ91ZA3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PccaQ91ZA3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PccaQ91ZA3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PccaQ91ZA3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PccaQ91ZA3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PccaQ91ZA3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PccaQ91ZA3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PccaQ91ZA3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PccaQ91ZA3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PccaQ91ZA3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PccaQ91ZA3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PccaQ91ZA3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PccaQ91ZA3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PccaQ91ZA3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PccaQ91ZA3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PccaQ91ZA3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PccaQ91ZA3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PccaQ91ZA3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PccaQ91ZA3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PccaQ91ZA3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PccaQ91ZA3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PccaQ91ZA3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PccaQ91ZA3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PccaQ91ZA3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PccaQ91ZA3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PccaQ91ZA3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PccaQ91ZA3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PccaQ91ZA3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PccaQ91ZA3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PccaQ91ZA3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PccaQ91ZA3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PccaQ91ZA3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PccaQ91ZA3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PccaQ91ZA3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PccaQ91ZA3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PccaQ91ZA3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PccaQ91ZA3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PccaQ91ZA3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PccaQ91ZA3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PccaQ91ZA3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PccaQ91ZA3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PccaQ91ZA3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PccaQ91ZA3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PccaQ91ZA3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PccaQ91ZA3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PccaQ91ZA3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PccaQ91ZA3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PccaQ91ZA3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PccaQ91ZA3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PccaQ91ZA3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PccaQ91ZA3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PccaQ91ZA3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PccaQ91ZA3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PccaQ91ZA3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PccaQ91ZA3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PccaQ91ZA3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PccaQ91ZA3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PccaQ91ZA3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PccaQ91ZA3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PccaQ91ZA3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PccaQ91ZA3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PccaQ91ZA3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PccaQ91ZA3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PccaQ91ZA3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PccaQ91ZA3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PccaQ91ZA3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PccaQ91ZA3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PccaQ91ZA3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PccaQ91ZA3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PccaQ91ZA3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PccaQ91ZA3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PccaQ91ZA3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PccaQ91ZA3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PccaQ91ZA3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PccaQ91ZA3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PccaQ91ZA3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms