Protein–RNA interactions for Protein: Q91Z40

Gbp7, Gbp6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp7Q91Z40 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Gbp7Q91Z40 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Gbp7Q91Z40 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Gbp7Q91Z40 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
Gbp7Q91Z40 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
Gbp7Q91Z40 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Gbp7Q91Z40 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Gbp7Q91Z40 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Gbp7Q91Z40 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Gbp7Q91Z40 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Gbp7Q91Z40 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Gbp7Q91Z40 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Gbp7Q91Z40 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Gbp7Q91Z40 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Gbp7Q91Z40 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Gbp7Q91Z40 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Gbp7Q91Z40 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Gbp7Q91Z40 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Gbp7Q91Z40 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Gbp7Q91Z40 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Gbp7Q91Z40 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Gbp7Q91Z40 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Gbp7Q91Z40 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Gbp7Q91Z40 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Gbp7Q91Z40 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Gbp7Q91Z40 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Gbp7Q91Z40 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Gbp7Q91Z40 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Gbp7Q91Z40 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Gbp7Q91Z40 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Gbp7Q91Z40 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Gbp7Q91Z40 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Gbp7Q91Z40 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Gbp7Q91Z40 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Gbp7Q91Z40 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Gbp7Q91Z40 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Gbp7Q91Z40 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Gbp7Q91Z40 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Gbp7Q91Z40 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Gbp7Q91Z40 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Gbp7Q91Z40 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Gbp7Q91Z40 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Gbp7Q91Z40 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Gbp7Q91Z40 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Gbp7Q91Z40 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gbp7Q91Z40 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gbp7Q91Z40 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Gbp7Q91Z40 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Gbp7Q91Z40 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Gbp7Q91Z40 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Gbp7Q91Z40 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Gbp7Q91Z40 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Gbp7Q91Z40 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Gbp7Q91Z40 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Gbp7Q91Z40 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Gbp7Q91Z40 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Gbp7Q91Z40 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Gbp7Q91Z40 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Gbp7Q91Z40 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Gbp7Q91Z40 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Gbp7Q91Z40 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Gbp7Q91Z40 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Gbp7Q91Z40 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Gbp7Q91Z40 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Gbp7Q91Z40 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Gbp7Q91Z40 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Gbp7Q91Z40 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Gbp7Q91Z40 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Gbp7Q91Z40 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gbp7Q91Z40 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gbp7Q91Z40 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gbp7Q91Z40 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Gbp7Q91Z40 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Gbp7Q91Z40 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Gbp7Q91Z40 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Gbp7Q91Z40 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Gbp7Q91Z40 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Gbp7Q91Z40 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Gbp7Q91Z40 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Gbp7Q91Z40 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Gbp7Q91Z40 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Gbp7Q91Z40 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Gbp7Q91Z40 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Gbp7Q91Z40 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Gbp7Q91Z40 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gbp7Q91Z40 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gbp7Q91Z40 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gbp7Q91Z40 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Gbp7Q91Z40 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Gbp7Q91Z40 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Gbp7Q91Z40 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Gbp7Q91Z40 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Gbp7Q91Z40 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Gbp7Q91Z40 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Gbp7Q91Z40 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Gbp7Q91Z40 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Gbp7Q91Z40 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Gbp7Q91Z40 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Gbp7Q91Z40 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Gbp7Q91Z40 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms