Protein–RNA interactions for Protein: Q91YY4

Atpaf2, ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atpaf2Q91YY4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atpaf2Q91YY4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atpaf2Q91YY4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atpaf2Q91YY4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atpaf2Q91YY4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atpaf2Q91YY4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atpaf2Q91YY4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atpaf2Q91YY4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atpaf2Q91YY4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atpaf2Q91YY4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atpaf2Q91YY4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atpaf2Q91YY4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atpaf2Q91YY4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atpaf2Q91YY4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atpaf2Q91YY4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Atpaf2Q91YY4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atpaf2Q91YY4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atpaf2Q91YY4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Atpaf2Q91YY4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atpaf2Q91YY4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atpaf2Q91YY4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atpaf2Q91YY4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atpaf2Q91YY4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atpaf2Q91YY4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atpaf2Q91YY4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Atpaf2Q91YY4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atpaf2Q91YY4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atpaf2Q91YY4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atpaf2Q91YY4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atpaf2Q91YY4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atpaf2Q91YY4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atpaf2Q91YY4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Atpaf2Q91YY4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atpaf2Q91YY4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Atpaf2Q91YY4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Atpaf2Q91YY4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atpaf2Q91YY4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atpaf2Q91YY4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atpaf2Q91YY4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atpaf2Q91YY4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atpaf2Q91YY4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atpaf2Q91YY4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atpaf2Q91YY4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atpaf2Q91YY4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atpaf2Q91YY4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atpaf2Q91YY4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atpaf2Q91YY4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atpaf2Q91YY4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atpaf2Q91YY4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atpaf2Q91YY4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atpaf2Q91YY4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atpaf2Q91YY4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atpaf2Q91YY4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Atpaf2Q91YY4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atpaf2Q91YY4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atpaf2Q91YY4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atpaf2Q91YY4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atpaf2Q91YY4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Atpaf2Q91YY4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Atpaf2Q91YY4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Atpaf2Q91YY4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atpaf2Q91YY4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atpaf2Q91YY4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atpaf2Q91YY4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atpaf2Q91YY4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atpaf2Q91YY4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atpaf2Q91YY4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atpaf2Q91YY4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atpaf2Q91YY4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Atpaf2Q91YY4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atpaf2Q91YY4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atpaf2Q91YY4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atpaf2Q91YY4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atpaf2Q91YY4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atpaf2Q91YY4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atpaf2Q91YY4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atpaf2Q91YY4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atpaf2Q91YY4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atpaf2Q91YY4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atpaf2Q91YY4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atpaf2Q91YY4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atpaf2Q91YY4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atpaf2Q91YY4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Atpaf2Q91YY4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atpaf2Q91YY4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atpaf2Q91YY4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atpaf2Q91YY4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atpaf2Q91YY4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atpaf2Q91YY4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atpaf2Q91YY4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Atpaf2Q91YY4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atpaf2Q91YY4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atpaf2Q91YY4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atpaf2Q91YY4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Atpaf2Q91YY4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Atpaf2Q91YY4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atpaf2Q91YY4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atpaf2Q91YY4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atpaf2Q91YY4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atpaf2Q91YY4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms