Protein–RNA interactions for Protein: Q91YU3

Msantd4, Myb/SANT-like DNA-binding domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msantd4Q91YU3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Msantd4Q91YU3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Msantd4Q91YU3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Msantd4Q91YU3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Msantd4Q91YU3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Msantd4Q91YU3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Msantd4Q91YU3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Msantd4Q91YU3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Msantd4Q91YU3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Msantd4Q91YU3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Msantd4Q91YU3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Msantd4Q91YU3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Msantd4Q91YU3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Msantd4Q91YU3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Msantd4Q91YU3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Msantd4Q91YU3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Msantd4Q91YU3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Msantd4Q91YU3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Msantd4Q91YU3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Msantd4Q91YU3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Msantd4Q91YU3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Msantd4Q91YU3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Msantd4Q91YU3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Msantd4Q91YU3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Msantd4Q91YU3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Msantd4Q91YU3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Msantd4Q91YU3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Msantd4Q91YU3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Msantd4Q91YU3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Msantd4Q91YU3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Msantd4Q91YU3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Msantd4Q91YU3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Msantd4Q91YU3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Msantd4Q91YU3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Msantd4Q91YU3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Msantd4Q91YU3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Msantd4Q91YU3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Msantd4Q91YU3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Msantd4Q91YU3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Msantd4Q91YU3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Msantd4Q91YU3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Msantd4Q91YU3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Msantd4Q91YU3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Msantd4Q91YU3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Msantd4Q91YU3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Msantd4Q91YU3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Msantd4Q91YU3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Msantd4Q91YU3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Msantd4Q91YU3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Msantd4Q91YU3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Msantd4Q91YU3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Msantd4Q91YU3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Msantd4Q91YU3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Msantd4Q91YU3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Msantd4Q91YU3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Msantd4Q91YU3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Msantd4Q91YU3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Msantd4Q91YU3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Msantd4Q91YU3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Msantd4Q91YU3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Msantd4Q91YU3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Msantd4Q91YU3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Msantd4Q91YU3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Msantd4Q91YU3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Msantd4Q91YU3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Msantd4Q91YU3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Msantd4Q91YU3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Msantd4Q91YU3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Msantd4Q91YU3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Msantd4Q91YU3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Msantd4Q91YU3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Msantd4Q91YU3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Msantd4Q91YU3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Msantd4Q91YU3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Msantd4Q91YU3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Msantd4Q91YU3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Msantd4Q91YU3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Msantd4Q91YU3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Msantd4Q91YU3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Msantd4Q91YU3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Msantd4Q91YU3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Msantd4Q91YU3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Msantd4Q91YU3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Msantd4Q91YU3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Msantd4Q91YU3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Msantd4Q91YU3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Msantd4Q91YU3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Msantd4Q91YU3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Msantd4Q91YU3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Msantd4Q91YU3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Msantd4Q91YU3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Msantd4Q91YU3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Msantd4Q91YU3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Msantd4Q91YU3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Msantd4Q91YU3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Msantd4Q91YU3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Msantd4Q91YU3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Msantd4Q91YU3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Msantd4Q91YU3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Msantd4Q91YU3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms