Protein–RNA interactions for Protein: Q91YR7

Prpf6, Pre-mRNA-processing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf6Q91YR7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prpf6Q91YR7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prpf6Q91YR7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Prpf6Q91YR7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prpf6Q91YR7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prpf6Q91YR7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prpf6Q91YR7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prpf6Q91YR7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prpf6Q91YR7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prpf6Q91YR7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prpf6Q91YR7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prpf6Q91YR7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Prpf6Q91YR7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prpf6Q91YR7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prpf6Q91YR7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prpf6Q91YR7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prpf6Q91YR7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prpf6Q91YR7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prpf6Q91YR7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prpf6Q91YR7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prpf6Q91YR7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prpf6Q91YR7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prpf6Q91YR7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prpf6Q91YR7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prpf6Q91YR7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prpf6Q91YR7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prpf6Q91YR7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prpf6Q91YR7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prpf6Q91YR7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prpf6Q91YR7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prpf6Q91YR7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prpf6Q91YR7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prpf6Q91YR7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prpf6Q91YR7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prpf6Q91YR7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prpf6Q91YR7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prpf6Q91YR7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prpf6Q91YR7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prpf6Q91YR7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prpf6Q91YR7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Prpf6Q91YR7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prpf6Q91YR7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prpf6Q91YR7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prpf6Q91YR7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prpf6Q91YR7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prpf6Q91YR7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prpf6Q91YR7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prpf6Q91YR7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prpf6Q91YR7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prpf6Q91YR7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prpf6Q91YR7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prpf6Q91YR7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prpf6Q91YR7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prpf6Q91YR7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prpf6Q91YR7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Prpf6Q91YR7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prpf6Q91YR7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prpf6Q91YR7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prpf6Q91YR7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prpf6Q91YR7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prpf6Q91YR7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Prpf6Q91YR7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prpf6Q91YR7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prpf6Q91YR7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prpf6Q91YR7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prpf6Q91YR7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prpf6Q91YR7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prpf6Q91YR7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prpf6Q91YR7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Prpf6Q91YR7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Prpf6Q91YR7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Prpf6Q91YR7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Prpf6Q91YR7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Prpf6Q91YR7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Prpf6Q91YR7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Prpf6Q91YR7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Prpf6Q91YR7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Prpf6Q91YR7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Prpf6Q91YR7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Prpf6Q91YR7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Prpf6Q91YR7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Prpf6Q91YR7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Prpf6Q91YR7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prpf6Q91YR7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prpf6Q91YR7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prpf6Q91YR7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prpf6Q91YR7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Prpf6Q91YR7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Prpf6Q91YR7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prpf6Q91YR7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prpf6Q91YR7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prpf6Q91YR7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prpf6Q91YR7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prpf6Q91YR7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prpf6Q91YR7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Prpf6Q91YR7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Prpf6Q91YR7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Prpf6Q91YR7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Prpf6Q91YR7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Prpf6Q91YR7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms