Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y06

Pcdhb13, Protocadherin beta 13, mousemouse

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhb13Q91Y06 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcdhb13Q91Y06 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcdhb13Q91Y06 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcdhb13Q91Y06 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcdhb13Q91Y06 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pcdhb13Q91Y06 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pcdhb13Q91Y06 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pcdhb13Q91Y06 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pcdhb13Q91Y06 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pcdhb13Q91Y06 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcdhb13Q91Y06 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcdhb13Q91Y06 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcdhb13Q91Y06 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcdhb13Q91Y06 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcdhb13Q91Y06 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcdhb13Q91Y06 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcdhb13Q91Y06 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcdhb13Q91Y06 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcdhb13Q91Y06 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcdhb13Q91Y06 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcdhb13Q91Y06 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcdhb13Q91Y06 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcdhb13Q91Y06 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcdhb13Q91Y06 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcdhb13Q91Y06 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcdhb13Q91Y06 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcdhb13Q91Y06 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcdhb13Q91Y06 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcdhb13Q91Y06 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcdhb13Q91Y06 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcdhb13Q91Y06 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcdhb13Q91Y06 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcdhb13Q91Y06 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcdhb13Q91Y06 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcdhb13Q91Y06 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pcdhb13Q91Y06 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pcdhb13Q91Y06 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Pcdhb13Q91Y06 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pcdhb13Q91Y06 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pcdhb13Q91Y06 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcdhb13Q91Y06 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcdhb13Q91Y06 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcdhb13Q91Y06 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcdhb13Q91Y06 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcdhb13Q91Y06 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcdhb13Q91Y06 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcdhb13Q91Y06 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcdhb13Q91Y06 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcdhb13Q91Y06 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcdhb13Q91Y06 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcdhb13Q91Y06 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcdhb13Q91Y06 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcdhb13Q91Y06 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcdhb13Q91Y06 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcdhb13Q91Y06 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcdhb13Q91Y06 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcdhb13Q91Y06 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcdhb13Q91Y06 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcdhb13Q91Y06 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcdhb13Q91Y06 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcdhb13Q91Y06 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcdhb13Q91Y06 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcdhb13Q91Y06 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcdhb13Q91Y06 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcdhb13Q91Y06 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcdhb13Q91Y06 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pcdhb13Q91Y06 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Pcdhb13Q91Y06 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pcdhb13Q91Y06 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pcdhb13Q91Y06 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pcdhb13Q91Y06 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcdhb13Q91Y06 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcdhb13Q91Y06 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcdhb13Q91Y06 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcdhb13Q91Y06 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcdhb13Q91Y06 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcdhb13Q91Y06 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcdhb13Q91Y06 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcdhb13Q91Y06 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcdhb13Q91Y06 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Pcdhb13Q91Y06 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcdhb13Q91Y06 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcdhb13Q91Y06 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcdhb13Q91Y06 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcdhb13Q91Y06 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcdhb13Q91Y06 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcdhb13Q91Y06 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcdhb13Q91Y06 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcdhb13Q91Y06 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcdhb13Q91Y06 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcdhb13Q91Y06 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcdhb13Q91Y06 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcdhb13Q91Y06 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcdhb13Q91Y06 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcdhb13Q91Y06 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcdhb13Q91Y06 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcdhb13Q91Y06 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcdhb13Q91Y06 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcdhb13Q91Y06 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcdhb13Q91Y06 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms