Protein–RNA interactions for Protein: Q91X84

Crtc3, CREB-regulated transcription coactivator 3, mousemouse

Predictions only

Length 619 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crtc3Q91X84 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Crtc3Q91X84 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Crtc3Q91X84 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Crtc3Q91X84 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Crtc3Q91X84 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Crtc3Q91X84 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Crtc3Q91X84 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Crtc3Q91X84 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Crtc3Q91X84 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Crtc3Q91X84 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Crtc3Q91X84 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Crtc3Q91X84 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Crtc3Q91X84 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Crtc3Q91X84 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Crtc3Q91X84 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Crtc3Q91X84 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Crtc3Q91X84 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Crtc3Q91X84 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Crtc3Q91X84 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Crtc3Q91X84 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Crtc3Q91X84 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Crtc3Q91X84 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Crtc3Q91X84 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Crtc3Q91X84 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Crtc3Q91X84 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Crtc3Q91X84 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Crtc3Q91X84 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Crtc3Q91X84 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Crtc3Q91X84 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Crtc3Q91X84 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Crtc3Q91X84 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Crtc3Q91X84 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Crtc3Q91X84 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Crtc3Q91X84 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Crtc3Q91X84 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Crtc3Q91X84 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Crtc3Q91X84 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Crtc3Q91X84 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Crtc3Q91X84 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Crtc3Q91X84 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Crtc3Q91X84 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Crtc3Q91X84 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Crtc3Q91X84 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Crtc3Q91X84 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Crtc3Q91X84 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Crtc3Q91X84 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Crtc3Q91X84 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Crtc3Q91X84 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Crtc3Q91X84 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Crtc3Q91X84 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Crtc3Q91X84 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Crtc3Q91X84 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Crtc3Q91X84 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Crtc3Q91X84 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Crtc3Q91X84 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Crtc3Q91X84 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Crtc3Q91X84 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Crtc3Q91X84 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Crtc3Q91X84 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Crtc3Q91X84 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Crtc3Q91X84 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Crtc3Q91X84 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Crtc3Q91X84 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Crtc3Q91X84 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Crtc3Q91X84 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Crtc3Q91X84 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Crtc3Q91X84 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Crtc3Q91X84 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Crtc3Q91X84 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Crtc3Q91X84 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Crtc3Q91X84 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Crtc3Q91X84 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Crtc3Q91X84 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Crtc3Q91X84 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Crtc3Q91X84 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Crtc3Q91X84 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Crtc3Q91X84 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Crtc3Q91X84 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Crtc3Q91X84 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Crtc3Q91X84 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Crtc3Q91X84 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Crtc3Q91X84 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Crtc3Q91X84 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Crtc3Q91X84 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Crtc3Q91X84 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Crtc3Q91X84 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Crtc3Q91X84 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Crtc3Q91X84 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Crtc3Q91X84 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Crtc3Q91X84 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Crtc3Q91X84 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Crtc3Q91X84 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Crtc3Q91X84 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Crtc3Q91X84 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Crtc3Q91X84 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Crtc3Q91X84 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Crtc3Q91X84 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Crtc3Q91X84 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Crtc3Q91X84 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Crtc3Q91X84 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms