Protein–RNA interactions for Protein: Q91WT9

Cbs, Cystathionine beta-synthase, mousemouse

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CbsQ91WT9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CbsQ91WT9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CbsQ91WT9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CbsQ91WT9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CbsQ91WT9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CbsQ91WT9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CbsQ91WT9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CbsQ91WT9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CbsQ91WT9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CbsQ91WT9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CbsQ91WT9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CbsQ91WT9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CbsQ91WT9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CbsQ91WT9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CbsQ91WT9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CbsQ91WT9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CbsQ91WT9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CbsQ91WT9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CbsQ91WT9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CbsQ91WT9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CbsQ91WT9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CbsQ91WT9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CbsQ91WT9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CbsQ91WT9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CbsQ91WT9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CbsQ91WT9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CbsQ91WT9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CbsQ91WT9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CbsQ91WT9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CbsQ91WT9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CbsQ91WT9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CbsQ91WT9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CbsQ91WT9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CbsQ91WT9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CbsQ91WT9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CbsQ91WT9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CbsQ91WT9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CbsQ91WT9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CbsQ91WT9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CbsQ91WT9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CbsQ91WT9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CbsQ91WT9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CbsQ91WT9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CbsQ91WT9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CbsQ91WT9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CbsQ91WT9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CbsQ91WT9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CbsQ91WT9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CbsQ91WT9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CbsQ91WT9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CbsQ91WT9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CbsQ91WT9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CbsQ91WT9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CbsQ91WT9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CbsQ91WT9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CbsQ91WT9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CbsQ91WT9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CbsQ91WT9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CbsQ91WT9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CbsQ91WT9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CbsQ91WT9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CbsQ91WT9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CbsQ91WT9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CbsQ91WT9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CbsQ91WT9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CbsQ91WT9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CbsQ91WT9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CbsQ91WT9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CbsQ91WT9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CbsQ91WT9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CbsQ91WT9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CbsQ91WT9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CbsQ91WT9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CbsQ91WT9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CbsQ91WT9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CbsQ91WT9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CbsQ91WT9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CbsQ91WT9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CbsQ91WT9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CbsQ91WT9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CbsQ91WT9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CbsQ91WT9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CbsQ91WT9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CbsQ91WT9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CbsQ91WT9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CbsQ91WT9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CbsQ91WT9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CbsQ91WT9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CbsQ91WT9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CbsQ91WT9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CbsQ91WT9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CbsQ91WT9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CbsQ91WT9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CbsQ91WT9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CbsQ91WT9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CbsQ91WT9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CbsQ91WT9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CbsQ91WT9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CbsQ91WT9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CbsQ91WT9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms