Protein–RNA interactions for Protein: Q91WC7

Nipal2, NIPA-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipal2Q91WC7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Nipal2Q91WC7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nipal2Q91WC7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nipal2Q91WC7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nipal2Q91WC7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nipal2Q91WC7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nipal2Q91WC7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nipal2Q91WC7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nipal2Q91WC7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nipal2Q91WC7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nipal2Q91WC7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nipal2Q91WC7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nipal2Q91WC7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nipal2Q91WC7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Nipal2Q91WC7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nipal2Q91WC7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nipal2Q91WC7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nipal2Q91WC7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nipal2Q91WC7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nipal2Q91WC7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nipal2Q91WC7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nipal2Q91WC7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nipal2Q91WC7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nipal2Q91WC7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nipal2Q91WC7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nipal2Q91WC7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nipal2Q91WC7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Nipal2Q91WC7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nipal2Q91WC7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nipal2Q91WC7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nipal2Q91WC7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nipal2Q91WC7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nipal2Q91WC7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Nipal2Q91WC7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nipal2Q91WC7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nipal2Q91WC7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nipal2Q91WC7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nipal2Q91WC7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nipal2Q91WC7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nipal2Q91WC7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nipal2Q91WC7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Nipal2Q91WC7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nipal2Q91WC7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nipal2Q91WC7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nipal2Q91WC7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nipal2Q91WC7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nipal2Q91WC7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nipal2Q91WC7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Nipal2Q91WC7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nipal2Q91WC7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nipal2Q91WC7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nipal2Q91WC7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nipal2Q91WC7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nipal2Q91WC7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nipal2Q91WC7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nipal2Q91WC7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nipal2Q91WC7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nipal2Q91WC7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nipal2Q91WC7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nipal2Q91WC7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nipal2Q91WC7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Nipal2Q91WC7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nipal2Q91WC7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nipal2Q91WC7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nipal2Q91WC7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nipal2Q91WC7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nipal2Q91WC7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nipal2Q91WC7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Nipal2Q91WC7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Nipal2Q91WC7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nipal2Q91WC7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nipal2Q91WC7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nipal2Q91WC7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nipal2Q91WC7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nipal2Q91WC7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nipal2Q91WC7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nipal2Q91WC7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nipal2Q91WC7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nipal2Q91WC7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nipal2Q91WC7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nipal2Q91WC7 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nipal2Q91WC7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Nipal2Q91WC7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nipal2Q91WC7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nipal2Q91WC7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nipal2Q91WC7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nipal2Q91WC7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nipal2Q91WC7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nipal2Q91WC7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nipal2Q91WC7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nipal2Q91WC7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nipal2Q91WC7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nipal2Q91WC7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nipal2Q91WC7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nipal2Q91WC7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nipal2Q91WC7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nipal2Q91WC7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nipal2Q91WC7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nipal2Q91WC7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nipal2Q91WC7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms